MoleculeNet HIV 数据集

数据集包含 41127 个样本,任务类型为分类,推荐使用 scaffold 划分和 AUROC 指标评估。该数据集可通过 scikit-fingerprints 库使用,适用于分子性质预测、药物发现和传染病相关研究(来源 Hugging Face,unknown 许可)

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2025-02-02 更新
浏览 3
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MoleculeNet_HIV

基本信息

模态
文本
大小
0.001830326 GB
任务类型
分类
许可
unknown
创建/更新时间
2025-02-02

资源简介

MoleculeNet HIV 数据集

scikit-fingerprints/MoleculeNet_HIV

MoleculeNet_HIV 是 MoleculeNet 基准中的 HIV 数据集,用于预测分子抑制 HIV 复制的能力。数据集包含 41127 个样本,任务类型为分类,推荐使用 scaffold 划分和 AUROC 指标评估。该数据集可通过 scikit-fingerprints 库使用,适用于分子性质预测、药物发现和传染病相关研究(来源 Hugging Face,unknown 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2024-07-07。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):MoleculeNet HIV HIV 数据集 [[1]](#1),属于 MoleculeNet [[2]](#2) 基准。它旨在通过 scikit-fingerprints 库使用。任务是预测分子抑制 HIV 复制的能力。 | 特征 | 描述 | |:------------------:|:---------------:| | 任务数 | 1 | | 任务类型 | 分类 | | 总样本数 | 41127 | | 推荐划分 | scaffold | | 推荐指标 | AUROC | 警告: 在较新的 RDKit 版本中,由于某些原子的高价态不被允许,原始数据集中的 7 个分子无法正确读取(见发布说明)。此版本的 HIV 数据集包含对这些分子的手动修复,修复通过交叉引用原始 NCI 数据 [[1]](#1)、PubChem 子结构搜索和视觉

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 2.43 MB。

【主题与分类】

主题标签:chemistry、biology、medical。本站分类:感染/艾滋病毒/艾滋病。

【获取与许可】

源站页面:https://huggingface.co/datasets/scikit-fingerprints/MoleculeNet_HIV

使用许可:unknown。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2025-02-02,引用时请注意版本时效。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取与加载(Hugging Face datasets)

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("scikit-fingerprints/MoleculeNet_HIV")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install && git clone https://hf-mirror.com/datasets/scikit-fingerprints/MoleculeNet_HIV

数据集大小约 1.8 MB。

仓库文件结构

  • .gitattributes
  • README.md
  • hiv.csv
  • ogb_splits_hiv.json

数据说明

scikit-fingerprints (2026). MoleculeNet_HIV [Dataset]. https://huggingface.co/datasets/scikit-fingerprints/MoleculeNet_HIV

完整数据卡:huggingface.co/datasets/scikit-fingerprints/MoleculeNet_HIV

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