暴露于宿主Caco-2和INT407肠细胞的弯曲杆菌蛋白质组学
该数据集来自ebi.ac.uk，属于感染/胃肠道感染分类，聚焦于弯曲杆菌（Campylobacter）在宿主肠道细胞暴露条件下的蛋白质组变化
基本信息
资源简介
暴露于宿主Caco-2和INT407肠细胞的弯曲杆菌蛋白质组学
PXD009817 是一个聚焦于弯曲杆菌（Campylobacter）在宿主肠道细胞暴露条件下蛋白质组变化的蛋白质组学数据集，来源为 ebi.ac.uk，在感染 / 胃肠道感染分类下收录。该数据集的核心比较对象是弯曲杆菌在不同培养与暴露条件下的蛋白质组，包括在 MH 培养基中、添加或不添加脱氧胆酸（deoxycholic acid）的条件下，以及在存在胎牛血清（FBS）或暴露于 INT 407 与 Caco-2 肠道上皮细胞之后的蛋白质组差异。数据集主题标签涵盖肠道、蛋白质组学、弯曲杆菌，并明确指向空肠弯曲杆菌（Campylobacter jejuni）。整体而言，该数据集可用于观察弯曲杆菌在宿主肠道细胞环境及相关培养条件变化下的蛋白表达差异。
【数据集背景】
弯曲杆菌是引起胃肠道感染的常见病原体之一，其与宿主肠道上皮细胞的相互作用是感染过程中的重要环节。该数据集围绕弯曲杆菌在宿主肠道细胞暴露条件下的蛋白质组变化展开，旨在比较不同培养条件与宿主细胞暴露条件下的蛋白表达差异。源站描述指出，该数据集比较了弯曲杆菌在 MH 培养基中、添加或不添加脱氧胆酸、在存在 FBS 或暴露于 INT 407 和 Caco-2 肠道上皮细胞后的蛋白质组。主题标签中包含空肠弯曲杆菌（Campylobacter jejuni），表明研究对象与该菌种相关。数据集所属分类为感染 / 胃肠道感染，提示其与胃肠道感染研究领域相关。
【数据内容】
该数据集的内容为蛋白质组学数据，涉及弯曲杆菌在不同条件下的蛋白质组比较。具体比较条件包括：在 MH 培养基中培养、在 MH 培养基中添加脱氧胆酸、在存在 FBS 的条件下，以及暴露于 INT 407 和 Caco-2 肠道上皮细胞之后。数据集主题标签包括 Intestine、Proteomics、Campylobacter，以及空肠弯曲杆菌相关的 NEWT 标识和 MS 标识。源站描述中提及的宿主细胞为 INT 407 和 Caco-2 肠道上皮细胞。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、蛋白鉴定数量、定量方法、仪器平台等更详细的数据内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于感染 / 胃肠道感染分类。源站描述说明其比较了弯曲杆菌在 MH 培养基中、添加或不添加脱氧胆酸、在存在 FBS 或暴露于 INT 407 和 Caco-2 肠道上皮细胞后的蛋白质组。数据集的英文名称为 PXD009817: Proteomics of campylobacter exposed to host Caco-2 and INT407 intestinal cells。除来源站和源站描述外，源站未提供关于具体实验流程、样本采集时间、细胞培养条件、质谱采集参数等更多采集与来源信息。
【适用场景】
该数据集适用于研究弯曲杆菌在宿主肠道细胞暴露条件下的蛋白质组变化，可用于比较不同培养条件（如 MH 培养基、脱氧胆酸添加、FBS 存在）与宿主细胞暴露条件（INT 407 和 Caco-2 肠道上皮细胞）之间的蛋白表达差异。其主题标签涵盖肠道、蛋白质组学和弯曲杆菌，并指向空肠弯曲杆菌，因此可应用于胃肠道感染相关研究、宿主-病原体相互作用研究以及细菌蛋白质组学比较分析等场景。源站未提供关于该数据集在其他具体应用场景中的使用说明。
【使用方法】
源站未提供关于该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具或复现步骤等。该数据集来源于 ebi.ac.uk，用户可依据该来源站的一般数据访问方式获取数据，但源站未提供针对该数据集的具体使用说明。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集的质量评估信息，包括数据完整性、重复性、定量准确性、覆盖度等。源站描述仅说明了比较条件，未提供关于样本数量、实验重复次数、统计分析方法或潜在偏差的详细信息。因此，该数据集的质量与限制需依据源站提供的原始信息进行判断，源站未提供进一步说明。
【引用与许可】
源站未提供关于该数据集的引用方式或许可信息。该数据集来源于 ebi.ac.uk，用户在使用时应参考该来源站的相关引用与许可政策，但源站未提供针对该数据集的具体引用格式或许可条款。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009817
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在含有或不含脱氧胆酸的MH培养基中，存在胎牛血清或暴露于INT 407和Caco2肠上皮细胞后，弯曲杆菌蛋白质组的比较。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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