沙门氏菌感染或未感染的体外M细胞与Caco-2细胞微阵列分析
该数据集来自NCBI GEO，标题为GSE73880，包含体外M细胞与Caco-2细胞在沙门氏菌感染或未感染条件下的微阵列表达谱数据
基本信息
资源简介
沙门氏菌感染或未感染的体外M细胞与Caco-2细胞微阵列分析
Microarray analysis of Salmonella-infected or uninfected in vitro M cells and Caco-2 cells
该数据集来自NCBI GEO，标题为GSE73880，包含体外M细胞与Caco-2细胞在沙门氏菌感染或未感染条件下的微阵列表达谱数据。研究目的是比较两种细胞间的差异表达基因，并探究S. Typhimurium及speG对两种细胞基因表达的影响。数据以GSE73880_series_matrix.txt.gz文件提供，主题标签涉及表达谱分析、GPL17077平台及9606物种。该数据可用于感染相关基因表达差异分析、宿主细胞应答研究及分类模型构建（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Oct 09 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：旨在研究体外M细胞与Caco-2细胞之间哪些基因存在差异表达，以及S. Typhimurium和speG如何影响这两种细胞的基因表达。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL17077、9606。本站分类：感染/胃肠道感染。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE73880
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 09 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE73880
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为了研究体外M细胞与Caco-2细胞之间哪些基因存在差异表达，以及鼠伤寒沙门氏菌和speG如何影响这两种细胞的基因表达。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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