白色念珠菌温度诱导opaque-to-white转换承诺点的转录组芯片分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-2834

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本实验旨在表征真菌病原体白色念珠菌温度诱导的不透明-白色转换中决定点的特征。本实验检查了野生型和WOR1/wor1菌株在50%决定点发生的转录组变化，以区分与决定相关的变化和实验假象，从而识别反映决定过程的转录组变化。这两个菌株具有不同的50%决定点[WOR1/wor1为2小时45分钟，野生型为5小时10分钟]。本实验提交的所有合并及整合数据文件可在ArrayExpress ftp站点的E-MEXP-2834.additional.zip存档中找到。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。