Trichosporon austroamericanum及相关酵母的比较基因组学数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB20459

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们对16株酵母菌进行了全基因组测序，其中包括3株源自血液的南美毛孢子菌（Trichosporon austroamericanum）分离株，以及从日本微生物保藏中心（Japan Collection of Microorganisms, JCM）购买的13株相关菌株。该数据集涵盖了毛孢子菌科（Trichosporonaceae）内的多个属，包括毛孢子菌属（Trichosporon）、阿皮毛孢子菌属（Apiotrichum）和皮毛孢子菌属（Cutaneotrichosporon）。基因组组装采用牛津纳米孔（Oxford Nanopore）测序技术完成，随后进行了校正和完整性评估。该数据集为毛孢子菌科酵母的比较基因组学和分类学研究提供了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。