数字细菌种类显微图像数据集
DIBaS 数据集是微生物学与计算机视觉交叉领域广受推崇的数据源之一，专门收集了大量高分辨率的临床常见细菌革兰氏染色显微图像。在复杂性尿路感染（cUTI）的临床诊断与干预中，快速、准确地鉴定出致病菌株（例如大肠埃希菌、变形杆菌、肠球菌或克雷伯菌等）对于及时调整经验性抗菌方案至关重要。该数据集共包含了数十种不同类型细菌的显微视野图像，每种细菌都有明确的微生物学分类标签。研究人员经常将其用来训练和评测图像分类网络，以期实现致病微生物的自动化形态学定性检测。
基本信息
模态
图像
大小
2.5 GB
数据量
660
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2017-01-01
资源简介
包含多种引发临床感染（包括复杂性尿路感染常见病原体如大肠杆菌、肺炎克雷伯菌）的细菌显微染色图像，常用于病原微生物种类鉴定。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：http://misztal.edu.pl/software/databases/dibas/
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 2.50 GB。
数据说明
包含多种引发临床感染（包括复杂性尿路感染常见病原体如大肠杆菌、肺炎克雷伯菌）的细菌显微染色图像，常用于病原微生物种类鉴定。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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