GSE94274:理解宿主-病原体相互作用的整合方法

GSE94274 是一个 SuperSeries,由若干 SubSeries 组成,主题为理解宿主-病原体相互作用的整合方法,本站归类于感染 / 血流感染

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基因组分类GPL149545850
GSE94274: An Integrated Approach to Understanding Host-Pathogen Interactions

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

GSE94274:理解宿主-病原体相互作用的整合方法

GSE94274 是一个以“理解宿主-病原体相互作用的整合方法”为主题的 SuperSeries 数据集,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,本站将其归类于感染 / 血流感染方向。该数据集由若干 SubSeries 组成,旨在通过整合性的研究思路刻画宿主与病原体之间的相互作用过程。数据集作者为 Mary 与 Galinski,发布时间为 Jan 30 201,包含 1 个文件,文件样例为 GSE94274_series_matrix.txt.gz。主题标签涉及 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL14954 以及 5850。整体而言,该数据集面向感染与血流感染相关研究场景,提供可用于表达谱分析的数据资源,适合在宿主-病原体相互作用研究框架下进行探索与再利用。

【数据集背景】

该数据集的全称为 GSE94274: An Integrated Approach to Understanding Host-Pathogen Interactions,源站标题为 An Integrated Approach to Understanding Host-Pathogen Interactions。从标题可以看出,其核心关注点在于以整合性方法研究宿主与病原体之间的相互作用。本站将其归入感染 / 血流感染分类,说明该数据集在应用层面上与感染性疾病、尤其是血流感染方向的研究具有关联。数据集由若干 SubSeries 组合而成,属于 SuperSeries 类型,这意味着它并非单一实验的简单集合,而是围绕同一研究主题对多个子系列进行汇总与组织,便于研究者从整体视角理解宿主-病原体互作的多层次信息。作者为 Mary 与 Galinski,发布时间为 Jan 30 201。

【数据内容】

该数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE94274_series_matrix.txt.gz。从文件形式来看,该文件为 GZIP 压缩包,通常用于存储系列矩阵数据。主题标签中包含 Expression profiling by high throughput sequencing,表明该数据集涉及高通量测序的表达谱分析;同时列出 GPL14954 与 5850,分别指向特定的平台或相关标识信息。由于该数据集为 SuperSeries,其数据内容由若干 SubSeries 组成,源站描述也明确指出“This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.”。除上述信息外,关于具体样本数量、分组设计、测序深度、基因覆盖度等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 体系下的公共数据资源。作者为 Mary 与 Galinski,发布时间为 Jan 30 201。数据集以 SuperSeries 形式组织,整合了若干 SubSeries,主题聚焦于宿主-病原体相互作用的整合研究。本站分类为感染 / 血流感染,说明其在感染性疾病研究领域具有潜在应用价值。关于具体的采集地点、样本来源、伦理审批信息、实验操作流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于感染与血流感染相关的宿主-病原体相互作用研究。由于主题标签包含 Expression profiling by high throughput sequencing,其数据可用于高通量测序表达谱的分析与挖掘。研究者可基于该 SuperSeries 所整合的 SubSeries,从整合视角探讨宿主与病原体之间的互作机制。此外,该数据集也可用于方法学参考,例如在整合性研究设计中作为数据组织与汇总的示例。关于具体的疾病模型、细胞类型、时间节点等适用细节,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可下载数据文件 GSE94274_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,读取时需按相应格式进行解压与解析。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因格式或编码问题导致的分析偏差。由于该数据集为 SuperSeries,实际分析时可能需要结合其下属 SubSeries 的信息进行综合解读。关于具体的分析流程、软件工具、参数设置等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI 来源的公共数据资源,以 SuperSeries 形式组织,包含 1 个文件。其主题标签涉及高通量测序表达谱分析,平台标识为 GPL14954 与 5850。由于源站描述仅说明该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,未提供更详细的质控指标、重复性信息、批次效应说明等,因此在使用时需自行评估数据质量与适用性。此外,发布时间为 Jan 30 201,关于后续更新或版本变更情况,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Mary 与 Galinski,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制等信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应遵循来源站的相关规定与通用学术规范。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE94274

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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