疟疾宿主病原体相互作用中心实验S01：感染食蟹猴疟原虫的恒河猴培养细胞宿主与寄生虫基因转录丰度

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE110970

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目是疟疾宿主-病原体相互作用中心（MaHPIC）的一部分——MaHPIC是一个跨学科的疟疾系统生物学研究项目，最初由NIH/NIAID合同（# HHSN272201200031C，2012-2017；见http://www.systemsbiology.emory.edu）资助。MaHPIC目前继续得到美国国防高级研究计划局（DARPA）及其他机构的支持。MaHPIC产生多种数据类型（如临床、血液学、寄生虫学、代谢组学、功能基因组学、脂质组学、蛋白质组学、免疫反应、遥测）和数学模型，以迭代测试和提出与非人灵长类（NHPs）疟疾过程中复杂的宿主-寄生虫动力学相关的假设，并通过与在疟疾流行国家开展临床研究的研究人员合作获取代谢组学数据，其总体目标是更好地理解人类疾病、发病机制和免疫。所有数据和元数据的策展与维护由MaHPIC负责。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。