病原体倍性与遗传背景互作产生的毒力表型

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A6f1b2932a21ca3ae6567a86d535988d089932127cf1a51536eedc2ed5ca18d12

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数据说明

研究真菌毒力往往具有挑战性，且常常取决于多种背景因素，包括宿主免疫状态和病原体遗传背景。然而，在研究真核病原体的毒力时，倍性的作用常常被忽视。由于真菌病原体（包括人类机会性病原体白色念珠菌）可表现出广泛的倍性变异，评估倍性如何影响毒力具有重要的临床意义。作为一种机会性病原体，白色念珠菌在健康个体中引起非致死性浅表感染，但在免疫功能受损的个体中可引起危及生命的血流感染。在此，我们通过对四对近等基因二倍体和四倍体菌株（涵盖实验室和临床遗传背景）的毒力表型进行表征，确定了白色念珠菌的倍性和遗传背景如何影响健康和免疫缺陷线虫宿主的毒力表型。我们发现白色念珠菌感染降低了宿主存活率并对宿主繁殖产生负面影响，并利用这两项指标来调查多种白色念珠菌中的致死性和非致死性毒力表型。

白色念珠菌菌株。在本研究中，我们发现无论病原体的倍性或遗传背景如何，与健康宿主相比，免疫缺陷宿主均易受真菌感染。此外，对于每种宿主背景，我们发现白色念珠菌遗传背景与倍性在毒力表型上存在显著交互作用，但未观察到二倍体与四倍体病原体之间的整体差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。