AT-EAE诱导小鼠脊髓转录组改变数据集
该数据集来源于omicsdi.org,属于免疫系统疾病/其他分类,主题为转录组学。数据比较了对照组(C)与AT-EAE组(E)小鼠脊髓提取的RNA样本,采用“Multiple Yellow”策略,将4个不同的C提取物与两张芯片杂交、4个不同的E提取物与另外两张芯片杂交,分别比较绿/红归一化信号并平均

基本信息
资源简介
AT-EAE诱导小鼠脊髓转录组改变数据集
该数据集来源于omicsdi.org,属于免疫系统疾病/其他分类,主题为转录组学。数据比较了对照组(C)与AT-EAE组(E)小鼠脊髓提取的RNA样本,采用“Multiple Yellow”策略,将4个不同的C提取物与两张芯片杂交、4个不同的E提取物与另外两张芯片杂交,分别比较绿/红归一化信号并平均E/C比值。关键词包括white matter、inflammation、cDNA microarray、experimental autoimmune encephalomyelitis。该数据可用于研究实验性自身免疫性脑脊髓炎相关的脊髓转录组改变及炎症、白质相关机制(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们使用“Multiple Yellow”策略比较了从对照组(C)和AT-EAE(E)小鼠脊髓提取的RNA样本。4个不同的C提取物与两张芯片杂交,4个不同的E提取物与另外两张芯片杂交,分别比较绿/红归一化信号并平均E/C比值。关键词 = white matter 关键词 = inflammation 关键词 = cDNA microarray 关键词 = experimental autoimmune encephalomyelitis
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-2446
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-2446
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用“Multiple Yellow”策略,比较了从对照组(C)和AT-EAE(E)小鼠脊髓中提取的RNA样本。将4份不同的C提取物与两张玻片杂交,4份不同的E提取物与另外两张玻片杂交,分别比较绿/红归一化信号,并计算E/C比值的平均值。关键词 = 白质 关键词 = 炎症 关键词 = cDNA微阵列 关键词 = 实验性自身免疫性脑脊髓炎
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




