人类Graves病短期与长期病程样本的转录组芯片分析

主题标签:Graves病、免疫系统疾病、转录组分析、芯片表达谱、病程样本。本站分类:免疫系统疾病/其他。本数据集为免疫系统疾病领域公开数据集,主题涵盖Graves病。

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基因组分类Graves病免疫系统疾病转录组分析芯片表达谱病程样本
Transcription profiling by array of human Graves disease short and long course samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

人类Graves病短期与长期病程样本的转录组芯片分析

该数据集英文名为 Transcription profiling by array of human Graves disease short and long course samples,是一项面向免疫系统疾病研究的公开转录组数据集,聚焦于人类Graves病(毒性弥漫性甲状腺肿)的短病程与长病程样本。数据集通过芯片表达谱技术对样本进行转录水平分析,主题涵盖Graves病、免疫系统疾病、转录组分析、芯片表达谱与病程样本等方向,在站内归类为免疫系统疾病/其他。该数据集来源于 ebi.ac.uk,原始记录由 Marta Ruiz Riol 于2011年发布,可作为免疫系统疾病领域特别是Graves病相关表达谱研究的公开数据资源使用。

【数据集背景】

Graves病是一种与免疫系统相关的疾病,本数据集以该疾病为研究对象,围绕短病程与长病程两类样本展开转录组层面的表达谱分析。数据集的主题标签包括Graves病、免疫系统疾病、转录组分析、芯片表达谱与病程样本,体现出其研究关注点在于疾病不同病程阶段的基因转录特征。该数据集在站内被归入免疫系统疾病/其他分类,属于免疫系统疾病领域的公开数据集,主题涵盖Graves病。数据集的发布年份为2011年,发布者为Marta Ruiz Riol。

【数据内容】

该数据集为转录组分析数据,采用芯片表达谱(array)技术路线,数据类型为转录谱分析(Transcription profiling by array)。样本对象为人类Graves病的短病程样本与长病程样本,即围绕同一疾病的不同病程阶段组织样本进行表达谱测定。数据集名称中明确体现了“short and long course samples”,说明样本按病程长短进行区分。除上述主题与样本类型信息外,源站未提供关于样本数量、基因数量、平台型号、数据文件格式与数据规模的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站记录中给出的描述为:Marta Ruiz Riol (2011). Transcription profiling by array of human Graves disease short and long course samples [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MEXP-2612/。据此可知,数据集通过ArrayExpress平台发布,实验编号为E-MEXP-2612,发布年份为2011年,发布者为Marta Ruiz Riol。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批与临床信息等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于免疫系统疾病领域的转录组研究,尤其是针对Graves病短病程与长病程样本的表达谱比较分析。其潜在用途包括:基于芯片表达谱数据考察不同病程阶段样本的转录特征差异;作为Graves病相关基因表达研究的公开数据资源用于方法验证与结果对照;在免疫系统疾病/其他分类下作为疾病转录组数据集的参考示例。需要说明的是,上述用途系基于数据集主题与数据类型的一般性说明,源站未提供关于具体应用案例或分析结论的信息。

【使用方法】

该数据集以芯片表达谱形式提供,可通过源站记录中给出的链接(https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MEXP-2612/)访问。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理流程、标准化方法与分析工具等具体使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为2011年发布的公开芯片表达谱数据集,样本按Graves病短病程与长病程进行区分。关于数据质量评估指标、样本量、缺失值情况、批次效应与验证结果等信息,源站未提供。使用时应结合源站记录自行核实数据的具体内容与适用范围。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参照源站描述中的引用信息:Marta Ruiz Riol (2011). Transcription profiling by array of human Graves disease short and long course samples [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MEXP-2612/。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MEXP-2612

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Marta Ruiz Riol (2011). Transcription profiling by array of human Graves disease short and long course samples [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MEXP-2612/

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