人类全miRNome项目第1版
该数据集来自ebi.ac.uk,为人类全miRNome项目第1版,采用转录组芯片分析技术,检测了454份外周血样本,涵盖健康对照及14种疾病患者,包括多种癌症、多发性硬化、急性心肌梗死和慢性炎症等

基本信息
资源简介
人类全miRNome项目第1版
The human Whole miRNOme project version 1
该数据集来自ebi.ac.uk,为人类全miRNome项目第1版,采用转录组芯片分析技术,检测了454份外周血样本,涵盖健康对照及14种疾病患者,包括多种癌症、多发性硬化、急性心肌梗死和慢性炎症等。所有样本按同一标准操作流程采集、测量和分析,旨在整合分析全部已知miRNA,探索复杂表达谱而非单一标志物,以提升疾病诊断的特异性。数据可用于疾病分类、诊断标志物筛选及复杂miRNA表达模式研究(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本项目分析了健康对照和14种不同疾病患者的外周血图谱,所有样本均使用完全相同的标准操作流程采集、测量和分析。由于已知miRNA是有价值的诊断标志物,我们探究了能否在外周血样本而非活检组织中检测到患者各自的模式。该项目旨在加深对复杂图谱而非单一标志物的理解。因此,需要一种高通量技术,整合性地分析所有已知miRNA,并联合不同疾病以达到高度特异性。共筛查了454份样本,包含不同癌症类型(肺癌、黑色素瘤、前列腺癌、Wilms瘤、胃肿瘤、胰腺癌、卵巢癌)、自身免疫性疾病(多发性硬化)、心血管疾病(急性心肌梗死)和慢性炎症的患者。
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:免疫系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-31568
下载信息
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源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-31568
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Andreas Keller; Petra Leidinger (2011). The human Whole miRNOme project version 1 [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-31568
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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