FluPRINT 数据库
什么是 FluPRINT 数据库。FluPRINT 代表了来自八项临床研究的完全整合且标准化的免疫学测量数据,这些研究取自 2007 年至 2015 年在 Stanford Human Immune Monitoring Center 接受灭活或减毒季节性流感疫苗接种的 740 名个体

基本信息
资源简介
FluPRINT 数据库
是一个面向流感疫苗接种免疫应答研究的综合性临床免疫学数据集,汇集了来自八项临床研究的完整且经过标准化的免疫学测量结果。这些数据取自 2007 年至 2015 年间在 Stanford Human Immune Monitoring Center 接受灭活或减毒季节性流感疫苗接种的 740 名个体。该数据集涵盖通过质谱流式、流式细胞术、磷酸化特异性流式细胞术、多重细胞因子检测、临床实验室检测(激素与全血细胞计数)、血清学分析和病毒学检测所测得的 3000 多项参数。疫苗保护效果通过血凝抑制试验衡量,并依据 FDA 指南,根据接种后 HAI 抗体滴度将个体标记为高应答者或低应答者。该数据集由 Tomic, Adriana 与 Tomic, Ivan 发布,托管于 Zenodo,发布时间为 2019 年,采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可,主题标签包括流感疫苗、系统免疫学和临床数据集。
【数据集背景】
FluPRINT 数据库旨在为流感疫苗接种后的免疫应答研究提供一套整合、标准化的数据资源。其数据来源于 2007 年至 2015 年间在 Stanford Human Immune Monitoring Center 开展的八项临床研究,涉及接受灭活或减毒季节性流感疫苗接种的 740 名个体。该数据集属于免疫系统疾病 / 其他分类,来源站为 doi.org。数据集的核心目标之一是将多项临床研究中的免疫学测量结果进行完全整合与标准化,从而支持对疫苗接种后免疫应答的系统性分析。疫苗保护效果通过血凝抑制试验进行评估,并按照 FDA 指南,依据接种后 HAI 抗体滴度将个体划分为高应答者或低应答者。
【数据内容】
该数据集包含 3000 多项参数,测量手段覆盖质谱流式、流式细胞术、磷酸化特异性流式细胞术、多重细胞因子检测、临床实验室检测(激素与全血细胞计数)、血清学分析和病毒学检测。这些参数共同构成了对流感疫苗接种后免疫状态的多个层面的刻画。数据集中还包含疫苗保护效果的衡量指标,即通过血凝抑制试验测定的 HAI 抗体滴度,并据此将个体标记为高应答者或低应答者。关于各项参数的具体名称、单位、取值范围及完整列表,源站未提供。
【采集与来源】
数据采集自八项临床研究,时间跨度为 2007 年至 2015 年,采集地点为 Stanford Human Immune Monitoring Center。研究对象为 740 名接受灭活或减毒季节性流感疫苗接种的个体。数据集的作者为 Tomic, Adriana 与 Tomic, Ivan,机构为 Zenodo,发布时间为 2019 年。关于各临床研究的纳入排除标准、受试者人口学特征、疫苗接种的具体剂次与时间安排等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于流感疫苗免疫应答相关的系统免疫学研究,可用于分析接种后多种免疫学参数的变化,以及探索高应答者与低应答者之间的差异。其主题标签包括流感疫苗、系统免疫学和临床数据集,表明其定位为面向临床与免疫学研究的资源。由于数据涵盖质谱流式、流式细胞术、磷酸化特异性流式细胞术、多重细胞因子检测、临床实验室检测、血清学分析和病毒学检测等多类测量,该数据集可用于跨平台、多参数的整合分析。关于具体的分析案例或已验证的应用场景,源站未提供。
【使用方法】
该数据集托管于 Zenodo,采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可,使用者可在遵守该许可条款的前提下获取和使用数据。关于数据文件的具体格式、目录结构、变量命名规则、配套代码或读取工具等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的一个显著特点是其免疫学测量结果经过了完全整合与标准化,这有助于跨研究、跨平台的数据比较。疫苗保护效果依据 FDA 指南通过 HAI 抗体滴度进行判定,并将个体划分为高应答者或低应答者,为免疫应答强度提供了明确的分类依据。然而,关于数据缺失情况、批次效应、不同临床研究之间的异质性、标准化方法的具体细节以及潜在的偏倚来源,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Tomic, Adriana 与 Tomic, Ivan,机构为 Zenodo,发布时间为 2019 年。许可方式为 Creative Commons Attribution 4.0 International。关于推荐的引用格式、DOI 具体标识以及数据版本信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.3222451
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 10.0 MB。
数据说明
什么是FluPRINT数据库?FluPRINT代表了来自八项临床研究的完全整合和标准化的免疫学测量数据,这些研究涉及2007年至2015年间在斯坦福人类免疫监测中心接种灭活或减毒活季节性流感疫苗的740名个体。FluPRINT数据集包含通过质谱流式细胞术、流式细胞术、磷酸化特异性流式细胞术、多重细胞因子检测、临床实验室测试(激素和全血细胞计数)、血清学分析和病毒学测试测量的3000多个参数的信息。在数据集中,疫苗保护效果通过血凝抑制(HAI)试验来衡量,并遵循FDA指南,根据接种疫苗后的HAI抗体滴度将个体标记为高应答者或低应答者。想了解更多?要了解FluPRINT数据集是如何生成和验证的,以及如何使用它,请参阅我们发表在《Scientific Data》杂志上的开放获取论文:Tomic, A., Tomic, I., Dekker, C.L. et al. The FluPRINT dataset, a multidimensional analysis of the influenza vaccine imprint on the immune system. Sci Data 6, 214 (2019).
https://doi.org/10.1038/s41597-019-0213-4 如需进一步探索,请访问项目网站:www.fluprint.com,您还可以通过以下链接探索FluPRINT数据集:https://fluprint.com/#/database-access。如果您想托管自己的FluPRINT数据库,请遵循我们在Github仓库中提供的说明:https://github.com/LogIN-/fluprint。如何使用FluPRINT?在这里,您可以下载整个FluPRINT数据库导出文件,格式为SQL文件或CSV文件。此外,我们还包含了用于获取这些文件的SQL查询文件。文件提供两种格式:zip和7zip(7z)。7zip是一款免费且开源的文件归档工具,可在此处下载:https://www.7-zip.org。在FluPRINT数据库中,有4个表:donor、donor_visits、experim
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




