ANRS CO21“Extreme”队列（CODEX）
该数据集来自clinicaltrials.gov，主题为HIV感染，属于免疫系统疾病/其他分类。源站描述介绍了法国两个具有HIV耐药表型的患者队列，其中ANRS CO15 ALT队列于1994年建立，纳入71例按免疫学标准定义的患者，并概述了16年随访后仍活跃随访6例及主要研究结果
基本信息
资源简介
ANRS CO21“Extreme”队列（CODEX）
the ANRS CO21 "Extreme" Cohort（CODEX）是一项以HIV感染为主题的数据集资源，在分类上归属于免疫系统疾病/其他类别，其来源站为clinicaltrials.gov。该数据集所对应的研究背景涉及法国两个具有HIV耐药表型的患者队列，其中ANRS CO15 ALT队列于1994年建立，共纳入71例按免疫学标准定义的患者，即CD4 T细胞计数高于600/mm³且在最近5年内至少三次连续检查中保持稳定或上升（斜率阳性或为零），无论病毒载量如何，同时已知HIV感染至少8年。经过16年随访，仍有6例患者处于活跃随访状态。该队列的主要研究结果包括病毒基因未出现缺失、未发现功能性病毒缺陷、病毒储存库规模较小，以及宿主具有独特的遗传特征（HLA、趋化因子），这些特征促成了与病毒控制相关的强效免疫细胞应答。
【数据集背景】
该数据集对应的研究关注HIV感染中一类特殊表型的患者群体。在法国存在两个具有HIV耐药表型的患者队列，ANRS CO15 ALT队列是其中较早建立的一个，于1994年成立。该队列的建立基于免疫学标准而非单纯的病毒学指标，纳入的患者需满足CD4 T细胞计数高于600/mm³，并且在最近5年内至少三次连续检查中CD4计数保持稳定或上升（斜率阳性或为零），无论病毒载量水平如何，同时已知HIV感染至少8年。一个由多个研究团队组成的联合体对这些患者的免疫病毒学特征进行了系统研究。经过16年随访，仍有6例患者处于活跃随访状态，这一长期随访数据构成了该数据集的重要背景。
【数据内容】
源站描述中呈现的核心内容包括：ANRS CO15 ALT队列纳入的71例患者按上述免疫学标准定义；经过16年随访后仍有6例患者活跃随访；主要研究结果涵盖病毒基因未出现缺失、未发现功能性病毒缺陷、病毒储存库规模较小，以及宿主具有独特的遗传特征（HLA、趋化因子），这些宿主特征导致强效免疫细胞应答并与病毒控制相关。关于数据集的具体变量、记录数量、文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于clinicaltrials.gov。其研究背景涉及法国两个具有HIV耐药表型的患者队列，ANRS CO15 ALT队列于1994年建立。患者纳入依据免疫学标准，即在最近5年内至少三次连续检查中CD4 T细胞计数高于600/mm³且保持稳定或上升，无论病毒载量如何，同时已知HIV感染至少8年。一个研究团队联合体对这些患者的免疫病毒学特征进行了研究。关于数据采集的具体流程、随访间隔的详细安排以及数据管理方式，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于与HIV感染相关的免疫病毒学研究场景，尤其是针对具有特殊免疫学表型（CD4计数长期稳定或上升）的HIV感染者群体的分析。其研究结果涉及病毒基因缺失情况、功能性病毒缺陷、病毒储存库规模以及宿主遗传特征（HLA、趋化因子）与免疫细胞应答和病毒控制之间的关系，可用于探讨宿主免疫遗传因素对HIV控制的潜在作用。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供。
【质量与限制】
该数据集所对应队列的随访时间较长，经过16年随访后仍有6例患者处于活跃随访状态，这提示长期随访数据可能存在样本量随时间减少的情况。源站描述中提及的主要研究结果包括病毒基因未出现缺失、未发现功能性病毒缺陷、病毒储存库规模较小以及宿主遗传特征与强效免疫细胞应答相关，但这些结果的详细统计指标和验证方式源站未提供。关于数据集的完整性、准确性评估以及使用限制，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT01520844
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件：HIV感染。法国存在两个具有HIV抵抗表型的患者队列。ANRS CO15 ALT队列成立于1994年。共纳入71名患者，其定义基于免疫学标准：CD4 T细胞计数高于600/mm³，且在最近5年内至少三次连续检查中计数稳定或呈上升趋势（斜率阳性或为零），无论病毒载量如何，且已知HIV感染至少8年。一个研究团队联盟对这些患者的免疫病毒学特征进行了研究。经过16年的随访，仍有6名患者在接受积极随访。主要结果显示，病毒基因未出现缺失，也无功能性病毒缺陷，病毒储存库规模较小，以及宿主具有独特的遗传特征（HLA、趋化因子），这些特征导致产生与病毒控制相关的强效免疫细胞应答。ANRS CO18 HIV控制者队列成立于2009年，源自2006年至2008年间活跃的法国国家HIV控制者观察站（ANRS EP36研究）。
共纳入152例符合病毒学标准的患者：在未接受任何抗逆转录病毒治疗的情况下，最近5次血浆病毒载量应低于400拷贝/mL，且为HIV感染超过5年的患者。一个研究团队联合体对这些患者进行了研究，结果表明控制者感染的是具有复制能力的HIV，HIV会感染CD4 T细胞，但CD4 T细胞中的病毒复制完全受CD8 T细胞控制。此外，ANRS EP47 VISCONTI研究确定了14例患者，他们在未接受抗逆转录病毒治疗的情况下，能够将血浆病毒载量维持在低于400拷贝/mL超过7年。与未接受过抗逆转录病毒治疗的HIV控制者不同，VISCONTI研究中的患者在原发感染后十周内开始治疗，并持续治疗中位时间为三年，随后停止治疗（治疗后控制者或PTC）。初步分析
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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