St. Jude 追踪COVID-19相关病毒与宿主因素研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04362995

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：COVID-19、冠状病毒感染、冠状病毒、SARS-CoV-2。未感染个体将在入组时提供基线血液样本。随后将进行常规采血，以确定无症状血清转阳参与者的比例；根据适应性研究设计，这些采血的时间安排及所需参与者比例将取决于队列中记录的SARS-CoV-2感染率。在整个期间，尤其是在感染清除后的早期阶段及随后，将对参与者进行SARS-CoV-2特异性抗体以及CD4和CD8 T细胞反应的追踪，以确定记忆反应的质量和持续时间。除血液样本外，参与者还将间歇性提供鼻拭子用于SARS-CoV-2检测；这可通过全面的主动员工筛查计划进行，或在参与者需到校但目前不符合员工筛查条件时，专门为本研究目的进行。这些检测将确定病毒排出的持续时间和特征，并识别再感染。

将确定血清阳性率估计值和无症状转化情况。诊断为COVID-19感染的个体将在急性期和恢复期额外进行两次采血，以识别急性和晚期免疫应答。这些应答将与基本基线样本数据进行比较，以表征从头应答和交叉反应性回忆应答的产生。对于接受疫苗接种的参与者，将在接种COVID疫苗后（完成1剂或2剂疗程后3-8周）和研究完成时进行采血。入组时，受试者将完成一份基线在线个人健康和人口统计学问卷，随后每月完成简短的在线健康更新问卷。在整个研究期间，受试者将每2周完成一次简短的在线症状调查。原SJTRC研究的参与者将被要求重新同意

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。