四核心基因型(FCG)小鼠脾细胞单细胞RNA测序

该数据集包含来自Four Core Genotypes(FCG)杂交小鼠脾细胞的单细胞基因表达谱。通过将Y染色体上Sry缺失与3号染色体上Sry转基因插入的小鼠杂交,产生四种性腺与染色体组合:XYSry-Chr3Sry+、XYSry-、XX、XXChr3Sry+

omicsdi
浏览 5
基因组分类Transcriptomics
Single-cell RNA-Sequencing of splenocytes from Four Core Genotype (FCG) mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-14

资源简介

四核心基因型(FCG)小鼠脾细胞单细胞RNA测序

该数据集包含来自Four Core Genotypes(FCG)杂交小鼠脾细胞的单细胞基因表达谱。通过将Y染色体上Sry缺失与3号染色体上Sry转基因插入的小鼠杂交,产生四种性腺与染色体组合:XYSry-Chr3Sry+、XYSry-、XX、XXChr3Sry+。转基因位于C57BL6遗传背景,并与CAST/EiJ雌鼠杂交以区分亲本单倍型。从四种基因型分离脾细胞后进行10x Genomics单细胞RNA测序,可用于研究性染色体与性腺对免疫细胞转录组的影响(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该存储库包含来自Four Core Genotypes杂交小鼠脾细胞的单细胞基因表达谱。通过将Y染色体上性别决定因子Sry缺失与3号染色体上Sry转基因插入的小鼠杂交,产生四种性腺(睾丸或卵巢)与染色体(XX或XY)组合,即XYSry-Chr3Sry+(性腺和染色体雄性)、XYSry-(性腺雌性、染色体雄性)、XX(性腺和染色体雌性)、XXChr3Sry+(性腺雄性、染色体雌性)。转基因位于C57BL6遗传背景,并与CAST/EiJ雌鼠杂交以区分亲本单倍型。从所有四种基因型中分离脾细胞,并进行10x Genomics单细胞RNA测序。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:免疫系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-13586

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-13586

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该资源库包含来自四核心基因型杂交小鼠脾细胞的单细胞基因表达谱。通过将Y染色体上性别决定因子Sry缺失的小鼠与3号染色体上转座子插入Sry的小鼠进行杂交,产生了四种性腺(睾丸或卵巢)与染色体(XX或XY)组合,即XYSry-Chr3Sry+(性腺和染色体均为雄性)、XYSry-(性腺为雌性,染色体为雄性)、XX(性腺和染色体均为雌性)、XXChr3Sry+(性腺为雄性,染色体为雌性)。这些转基因位于C57BL6遗传背景上,并与CAST/EiJ雌鼠杂交,以便区分亲本单倍型。从所有四种基因型中分离脾细胞,并对其进行10x Genomics单细胞RNA测序。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。