人原代pDCs经TLR9激动剂CpG刺激24小时前后的单细胞RNA测序

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-16728

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

浆细胞样树突状细胞（pDCs）是一种罕见的免疫细胞群体，在抗病毒先天免疫中发挥关键作用。在我们的分析中，促胰液素（SCT）是循环和组织驻留pDCs中表达最高的激素之一。为验证这一发现，我们对成人扁桃体组织进行了空间转录组分析，结果显示SCT转录本与pDC标志物LILR4A共定位。我们进一步通过原代人外周血pDCs的免疫荧光染色在蛋白质水平确认了SCT表达，显示促胰液素与经典pDC标志物CLEC4C和TLR9共表达。在一项来自COVID-19个体的纵向单细胞RNA测序数据集中，我们观察到干扰素激活的pDCs中SCT有适度上调。为确定SCT表达是否与免疫功能相关，我们购买了原代人外周血pDCs，并在体外用TLR9激动剂胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤（CpG）寡脱氧核苷酸刺激，随后进行单细胞转录组分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。