Rutgers COVID-19 队列研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04336215

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

研究条件：冠状病毒、SARS-CoV-2。本前瞻性纵向队列研究由以下部分组成：（1）来自两家RBHS医院的546名医护人员（HCW）：位于新不伦瑞克省的罗伯特·伍德·约翰逊大学医院（RWJUH）和位于纽瓦克市的大学医院（UH）；（两家医院的院长均已批准该研究）（2）来自罗格斯大学教职员工及无患者接触史的医院员工的283名非医护人员（NHCW）。在基线时，研究人员将采集鼻咽拭子或咽拭子、唾液和血液（分别用于检测SARS-CoV-2阳性和免疫力），并收集有关社会人口学因素、生活方式和病史的问卷数据。在研究的第一阶段，每两周采集一次鼻咽/咽拭子、唾液和血液，持续两个月，之后每月采集一次样本，再持续四个月（共9次访视，包括基线）。在研究的前两个月，每周收集每位参与者的问卷数据和每日体温数据。

研究人员将计算并比较医护人员与非医护人员中SARS-CoV-2阳性及COVID-19的发病率和危险因素，并评估症状及疾病严重程度。通过额外资金支持，我们将继续发放随访问卷并收集更多标本（主要用于血清学检测），直至2024年。我们的具体目标是：1. 评估研究人群中SARS-CoV-2和COVID-19的基线患病率。2. 描述SARS-CoV-2感染在多元化美国劳动力人群中的自然史，包括无症状感染和危重疾病的发生率。3. 确定医护人员与非医护人员相比SARS-CoV-2和COVID-19的发病率。4. 识别感染SARS-CoV-2和发展为COVID-19的危险因素。5. 确定SARS-CoV-2排毒的持续时间和范围。6. 确定对SARS-CoV-2感染和/或疫苗接种的免疫反应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。