QBC-CyTOF跨物种PBMC数据集:人与恒河猴单细胞蛋白及磷酸化信号谱

该数据集包含3名人类供体(H1-H3)和3只恒河猴(354/355/356)的外周血单个核细胞(PBMC),在基础条件及GM-CSF或CD40L刺激下,通过Quantum Barcoding(QBC;split-pool合成)蛋白测量与CyTOF质谱流式进行单细胞分析

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2026-10-16 更新
浏览 10
时间序列分类CyTOFMass CytometrySplit-Pool Quantum-BarcodingPBMCsCross-SpeciesRhesus MacaquePhospho-SignalingSingle Cell BiologySystems BiologyBayesian Network
QBC-CyTOF cross-species PBMC dataset: human and rhesus macaque single-cell protein and phospho-signaling profiles under basal and GM-CSF/CD40L stimulation

基本信息

模态
时间序列
大小
0.739336388 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-16
版本
1.0.0

资源简介

QBC-CyTOF跨物种PBMC数据集:人与恒河猴单细胞蛋白及磷酸化信号谱

QBC-CyTOF cross-species PBMC dataset: human and rhesus macaque single-cell protein and phospho-signaling profiles under basal and GM-CSF/CD40L stimulation

该数据集包含3名人类供体(H1-H3)和3只恒河猴(354/355/356)的外周血单个核细胞(PBMC),在基础条件及GM-CSF或CD40L刺激下,通过Quantum Barcoding(QBC;split-pool合成)蛋白测量与CyTOF质谱流式进行单细胞分析。数据涵盖原始CyTOF .fcs文件、原始/处理后的QBC .fcs及单细胞.csv文件,以及合并的单细胞表达矩阵,可用于跨物种聚类、MARIO整合及保守因果磷酸化信号关系的贝叶斯网络推断(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):伴随手稿《Split-Pool Synthesis Enables High-Dimensional Cross-Species Immune Cell Profiling and Signaling Quantification at Single-Cell Resolution》(Cell Systems,审稿中;bioRxiv预印本)的单细胞数据集。来自3名人类供体(H1-H3)和3只恒河猴(354/355/356)的外周血单个核细胞(PBMC)通过Quantum Barcoding(QBC;split-pool合成)蛋白测量和CyTOF质谱流式进行 profiling,在基础条件下以及GM-CSF或CD40L刺激后。内容:原始CyTOF .fcs文件,原始/处理后的QBC .fcs和每细胞.csv文件,以及合并的单细胞表达矩阵。这些数据支持跨物种聚类、MARIO整合以及保守因果磷酸化信号关系的贝叶斯网络推断。分析代码和处理后的Seurat对象在链接的GitHub仓库中提供。

【主题与分类】

主题标签:CyTOF、Mass Cytometry、Split-Pool Quantum-Barcoding、PBMCs、Cross-Species、Rhesus Macaque、Phospho-Signaling、Single Cell Biology、Systems Biology、Bayesian Network。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23406825

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 739.3 MB。

数据说明

伴随手稿《Split-Pool Synthesis Enables High-Dimensional Cross-Species Immune Cell Profiling and Signaling Quantification at Single-Cell Resolution》(Cell Systems,审稿中;bioRxiv预印本)的单细胞数据集。来自3名人类供者(H1-H3)和3只恒河猴(354/355/356)的外周血单个核细胞(PBMCs),在基础条件下以及GM-CSF或CD40L刺激后,通过Quantum Barcoding(QBC;split-pool合成)蛋白测量和CyTOF质谱流式细胞术进行了分析。内容包括:原始CyTOF .fcs文件,原始/处理后的QBC .fcs文件和单细胞.csv文件,以及合并的单细胞表达矩阵。这些数据支持跨物种聚类、MARIO整合以及保守因果磷酸化信号关系的贝叶斯网络推断。分析代码和处理后的Seurat对象见链接的GitHub仓库。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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