吸烟、免疫细胞谱、表观遗传学与COVID-19的前瞻性自然史研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04403386

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：COVID-19。研究描述：本研究是一项前瞻性、纵向、观察性、单中心、探索性研究，旨在收集样本和数据，以便探究吸烟、免疫系统特征与2019冠状病毒病（COVID-19）之间的相互作用。本研究将在COVID-19感染前收集基线样本和数据，这是前瞻性探索这些相互作用所必需的。COVID-19大流行的早期证据表明，吸烟者与COVID-19感染相关的发病率和死亡率风险更高。我们已经发现吸烟相关的表观遗传学改变、转录变化以及免疫细胞谱的变化。吸烟暴露导致初始CD8+ T细胞丢失和衰老CD8+ T细胞增加，这些效应是免疫系统功能障碍的标志。我们提出，与既往吸烟相关的免疫系统衰老是COVID-19发病的一个易感因素。

目标：主要目标：以可识别的方式，前瞻性地从符合条件的参与者中收集基线和纵向的生物样本及数据，并保留以供未来使用，以更好地理解吸烟史、免疫细胞谱与COVID-19发病自然史之间的相互作用。我们假设，在发展为COVID-19的吸烟者中，衰老CD8 T细胞会更高。为验证这一假设，我们将建立一个生物样本库，包含来自吸烟者和非吸烟者在COVID-19暴露前后的冷冻保存外周血单核细胞（PBMCs），并使用质谱流式细胞术（CyTOF）分析详细的免疫谱，检验发展为COVID-19（抗体阳性）的吸烟者中衰老CD8 T细胞的频率是否高于未发展为COVID-19阳性者。探索性目标：将病毒感染易感性的潜在免疫生物标志物与在COVID-19康复前后某一时间点血液中测量的遗传、表观遗传及其他生物学特征进行比较。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。