PRJNA793042：狼疮易感位点使小鼠易发克隆性淋巴细胞反应与髓系扩增
该数据集来自 NCBI BioProject（编号 PRJNA793042），主题为狼疮易感位点使小鼠易发克隆性淋巴细胞反应与髓系扩增
基本信息
资源简介
PRJNA793042：狼疮易感位点使小鼠易发克隆性淋巴细胞反应与髓系扩增
PRJNA793042 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物项目，其英文名称为“Lupus susceptibility loci predispose mice to clonal lymphocytic responses and myeloid expansion”。从名称可以看出，该项目围绕狼疮易感位点与小鼠克隆性淋巴细胞反应及髓系扩增之间的关系展开，属于免疫系统疾病相关研究范畴。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在将源自同一项研究计划或同一机构、联盟的多种类型数据汇聚于一处，便于用户集中查找与访问。该数据集在分类上归入免疫系统疾病 / 其他，主题标签为 Other，短描述进一步概括了其核心内容：狼疮易感位点使小鼠易发克隆性淋巴细胞反应与髓系扩增。整体而言，该数据集为研究狼疮遗传易感性如何影响淋巴细胞克隆性行为及髓系细胞扩增提供了项目层面的入口与索引。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 PRJNA793042。BioProject 是围绕单一研究计划组织起来的生物数据集合，其来源可以是单个机构，也可以是一个联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，用以发现该项目所产生的多种数据类型之间的链接。该项目的标题明确指出其研究关注点为狼疮易感位点与小鼠克隆性淋巴细胞反应及髓系扩增之间的关联，属于免疫系统疾病领域。本站将其分类为免疫系统疾病 / 其他，主题标签为 Other。
【数据内容】
源站未提供该项目所包含的具体数据类型、样本数量、测序平台、文件格式或数据规模等细节。已知的信息仅为项目名称、编号、分类与主题标签，以及其作为 BioProject 记录所具备的索引功能，即汇集与单一研究计划相关的多种数据类型并提供访问链接。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，具体以 BioProject 记录形式呈现，编号 PRJNA793042。源站描述说明，BioProject 记录本身并不直接等同于某一类具体实验数据，而是作为项目层面的汇总入口，指向由该计划产生的各类数据。关于样本采集方式、实验设计、物种品系、机构名称或联盟信息，源站未提供。
【适用场景】
基于项目名称所反映的主题，该数据集可能适用于免疫系统疾病尤其是狼疮相关遗传易感性研究的检索与数据定位，也可用于查找与小鼠克隆性淋巴细胞反应、髓系扩增相关的项目级数据入口。由于 BioProject 提供统一入口以链接同一计划下的多种数据类型，该记录适合作为进一步获取具体实验数据的起点。关于其是否适用于特定分析流程或临床场景，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以编号 PRJNA793042 或项目名称进行检索，访问该项目的记录页面，并经由记录中提供的链接查找该项目产生的各类数据。具体的数据下载方式、访问权限、所需工具或分析步骤，源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、完整性、准确性或使用限制的具体说明。该记录为 BioProject 项目层级条目，其本身不包含对具体数据质量的评价。用户如需评估数据质量，应参考该项目所链接的具体数据资源。其他限制信息源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可条款或使用条件。用户在使用相关数据时，应自行查阅 NCBI BioProject 记录页面及所链接数据资源中可能列出的引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA793042
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
狼疮易感性源于众多遗传位点的联合效应，但由于自身免疫反应中细胞的高度异质性，这些位点对疾病发病机制的贡献一直难以研究。我们对携带多个多态性狼疮易感位点小鼠的脾细胞进行了单细胞RNA、B细胞受体（BCR）和T细胞受体（TCR）测序。我们不仅观察到淋巴细胞和髓系细胞扩增，还刻画了亚群频率和基因表达的变化，例如CD8和边缘区B细胞减少，以及表达Fcrl5和Cd5l的巨噬细胞增加。克隆型分析揭示了B细胞和CD4克隆的扩增，并且通过算法特异性预测和无监督机器学习分类，可以将狼疮易感小鼠的TCR库区分开来。髓系细胞的差异基因表达、代谢以及配体-受体相互作用的改变与抗原呈递减少相关。该数据集为狼疮自发模型的病理生理学提供了新的机制性见解，突出了针对自身抗体介导疾病的潜在治疗靶点。
总体设计：对4只小鼠（2只对照和2只自身免疫小鼠）进行了scRNA-seq、scBCR-seq和scTCR-seq。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
