PRJNA767713：皮肤微生物组重构与脂质代谢谱改变揭示隐丹参酮治疗痤疮大鼠的作用机制
痤疮已成为最常见的皮肤疾病之一，在全球范围内影响着大多数年轻人的身心健康。隐丹参酮（CPT）是一种潜在的痤疮治疗药物，但其在微生物群层面的痤疮治疗机制尚未得到深入研究
基本信息
资源简介
PRJNA767713：皮肤微生物组重构与脂质代谢谱改变揭示隐丹参酮治疗痤疮大鼠的作用机制
痤疮是全球范围内最常见的皮肤疾病之一，对大多数年轻人的身心健康造成影响。隐丹参酮（CPT）被认为是一种具有潜力的痤疮治疗药物，但其在微生物群层面的治疗机制尚未得到深入研究。该数据集围绕隐丹参酮治疗痤疮大鼠模型展开，结合皮肤微生物组重构与脂质代谢谱改变两个维度，旨在揭示其治疗机制。研究采用16S rDNA测序检测皮肤微生物群组成，利用绝对定量脂质组学识别脂质代谢物谱水平，并通过免疫化学方法检测糖酵解通路的四个关键蛋白，同时开展抗菌分析以评估隐丹参酮对痤疮的治疗作用。该数据集属于免疫系统疾病及其他相关分类，来源于ebi.ac.uk。
【数据集背景】
痤疮已成为全球范围内影响大多数年轻人身心健康的常见皮肤疾病之一。隐丹参酮（CPT）是一种潜在的痤疮治疗药物，但其在微生物群层面的痤疮治疗机制尚未得到充分研究，皮肤微生物群与脂质代谢物在痤疮治疗中的变化也较少受到关注。该数据集正是针对这一研究空白而建立，聚焦于隐丹参酮在痤疮大鼠模型中的治疗机制，通过皮肤微生物组重构与脂质代谢谱改变两个层面的分析，探索其作用方式。
【数据内容】
该数据集的核心内容包括皮肤微生物群组成数据与脂质代谢物谱数据。研究采用16S rDNA测序检测皮肤微生物群组成，并利用绝对定量脂质组学识别脂质代谢物谱水平。此外，研究还通过免疫化学方法检测了糖酵解通路的四个关键蛋白，并开展抗菌分析以评估隐丹参酮对痤疮的治疗效果。结合皮肤微生物组与脂质组学分析，共获得29种差异表达菌群（DEFs）以及782个差异表达相关结果。抗菌分析结果显示，隐丹参酮显著抑制了表皮葡萄球菌（Staphylococcus epidermidis）和金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）。
【采集与来源】
该数据集的来源站为ebi.ac.uk。数据集英文名称为PRJNA767713: Skin Microbiome Restruction and Lipid Metabolism Profile Alteration Reveal the Treatment Mechanism of Cryptotanshinone in the Acne Rat。研究基于痤疮大鼠模型开展，涉及皮肤微生物群样本的16S rDNA测序、绝对定量脂质组学分析、免疫化学蛋白检测以及抗菌分析等多种实验手段。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及样本量等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于痤疮治疗机制研究，尤其是隐丹参酮在微生物群与脂质代谢层面的作用机制探索。可用于皮肤微生物组与脂质代谢组联合分析的研究场景，也可用于抗菌药物对表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌抑制效果的评价研究。此外，该数据集还可为糖酵解通路相关蛋白在痤疮治疗中的表达变化研究提供参考。适用于免疫系统疾病及其他相关领域的生物信息学分析与二次挖掘。
【使用方法】
该数据集可通过来源站ebi.ac.uk获取。使用者可基于16S rDNA测序数据进行皮肤微生物群组成分析，基于绝对定量脂质组学数据进行脂质代谢物谱分析，并结合差异表达菌群与差异表达脂质代谢物结果进行联合分析。免疫化学检测的糖酵解通路关键蛋白数据可用于通路层面的机制探讨。抗菌分析数据可用于评估隐丹参酮对特定葡萄球菌属的抑制效果。关于具体的数据格式、文件组织方式及分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于痤疮大鼠模型，研究结果向人体应用的转化需谨慎对待。研究中鉴定出29种差异表达菌群和782个差异表达相关结果，抗菌分析显示隐丹参酮对表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌具有显著抑制作用。然而，关于数据的具体质量控制指标、测序深度、脂质组学定量精度、样本重复数以及统计分析方法等细节，源站未提供。此外，该数据集仅涉及大鼠模型，未涵盖人体临床数据，其外推性存在局限。
【引用与许可】
该数据集的来源站为ebi.ac.uk，英文名称为PRJNA767713: Skin Microbiome Restruction and Lipid Metabolism Profile Alteration Reveal the Treatment Mechanism of Cryptotanshinone in the Acne Rat。关于具体的引用格式、许可协议类型以及使用限制等详细信息，源站未提供。
下载信息
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源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA767713
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
痤疮已成为最常见的皮肤疾病之一，在全球范围内影响着大多数年轻人的身心健康。隐丹参酮（CPT）是一种潜在的治疗痤疮药物，但其治疗痤疮的机制在微生物群方面尚未得到深入研究。关于痤疮治疗中皮肤微生物群和脂质代谢物变化的研究更是鲜有关注。采用16Sr DNA测序检测皮肤微生物群组成，并利用绝对定量脂质组学鉴定脂质代谢物谱水平。通过免疫化学方法检测糖酵解途径的四种关键蛋白。采用抗菌分析评估CPT治疗痤疮的效果。CPT显著抑制了表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌。结合皮肤微生物组与脂质组学分析，29种差异表达菌群（DEFs）和782种差异表达脂质代谢物（DELMs）发生显著改变，尤其是葡萄球菌属、棒状杆菌属、拉尔斯顿菌属、水杆菌属、伯克霍尔德菌属和链球菌属。
Cer主要受葡萄球菌属和棒状杆菌属调控，而TG和DG主要受罗尔斯通菌属、Enhydrobacter、伯克霍尔德菌属和链球菌属调控。在CPT治疗痤疮过程中，糖酵解途径受到葡萄球菌属的显著调控。能量代谢、脂质代谢、免疫系统、聚糖生物合成与代谢均可被CPT逆转。CPT可能有助于痤疮大鼠重建皮肤微生物群并改变脂质代谢特征。此外，皮肤微生物与皮肤脂质代谢物关系密切，且二者均受CPT调控，该工作可为发现皮肤微生物组失衡的生物标志物以及痤疮发生机制的靶向治疗提供研究基础。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
