PRJNA556711：IL-15、麸质与HLA-DQ8相互作用驱动小鼠乳糜泻发生

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE134900

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数据说明

乳糜泻（CeD）是一种复杂的多基因炎症性肠病，具有自身免疫特征，由膳食麸质暴露引起，发生于部分遗传易感的HLA-DQ8和HLA-DQ2个体中。试图开发能够出现绒毛萎缩（VA）的病理生理相关动物模型的尝试均未成功。目前人们已广泛认识到，有必要为这一常见疾病开发非饮食疗法，但由于缺乏临床前模型而受到阻碍。此外，尽管人类研究使我们对CeD发病机制的理解取得了重大进展，但仍缺乏对易感HLA分子以及适应性免疫和固有免疫在组织损伤发生中各自作用的直接证明。为满足这些未竟需求，我们构建了一种小鼠模型，该模型再现了活动性CeD特征性的肠上皮和固有层（Lp）中IL-15的双重过表达，表达易感HLA-DQ8分子，并在摄入麸质后出现VA。我们证明，上皮和Lp中IL-15的过表达均为VA发生所必需，这证明了IL-15在CeD发病机制中具有位置依赖性的核心作用。

此外，我们的研究揭示了CD4+和细胞毒性CD8+ T细胞在VA发展中的关键作用。最后，研究确认HLA-DQ8在组织破坏中起核心作用，但对于对麸质口服耐受性的丧失则是非必需的。该小鼠模型通过反映麸质、遗传因素与CeD中发现的IL-15驱动的组织炎症之间的复杂相互作用，为测试新疗法和研究疾病发病机制提供了一个强大的临床前模型。总体设计：我们从51名CeD患者和45名健康对照者的十二指肠活检样本中收集了RNA测序数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。