PRJNA1229425:接受胚系靶向Q23-APEX-GT2免疫原免疫的恒河猴纵向抗体序列

该数据集来自NCBI,包含12只恒河猴接种V2-Apex胚系靶向Q23-APEX-GT2免疫原后的去多重化纵向抗体测序数据

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基因组分类Raw sequence reads疫苗编码
PRJNA1229425: Longituinal antibody sequences from Rhesus Macaques immunized with germline targeting Q23-APEX-GT2 immunogen

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

PRJNA1229425:接受胚系靶向Q23-APEX-GT2免疫原免疫的恒河猴纵向抗体序列

PRJNA1229425 数据集收录了12只恒河猴(Macaca mulatta)在接种 V2-Apex 胚系靶向 Q23-APEX-GT2 免疫原后的去多重化纵向抗体测序数据。该研究在免疫前1个时间点及免疫后3个时间点追踪B细胞受体(BCR)库的演化,为理解免疫应答过程与抗体成熟进程提供序列层面的观察窗口。数据有助于评估 V2-Apex 胚系靶向策略在引导抗体向广谱中和表位方向发展方面的效果,对HIV-1疫苗设计具有参考意义。数据集以原始序列读段(Raw sequence reads)为主要内容形式,来源于 NCBI,在本站归入免疫系统疾病/其他类别。

【数据集背景】

该数据集围绕恒河猴接种胚系靶向免疫原后的抗体序列演化展开。研究使用的免疫原为 V2-Apex 胚系靶向 Q23-APEX-GT2,其设计思路是引导抗体发育朝向广谱中和表位,这一策略与HIV-1疫苗设计密切相关。通过纵向追踪免疫前后B细胞受体库的变化,可以观察免疫原在体内引发的B细胞应答轨迹以及抗体成熟的过程。数据集所承载的正是这一研究背景下产生的抗体测序数据。

【数据内容】

数据集包含来自12只恒河猴的去多重化纵向抗体测序数据。采样覆盖4个时间点,即免疫前1个时间点和免疫后3个时间点,因而具备纵向比较的基础。数据主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads),表明其内容以测序产生的原始读段为主,可用于后续的B细胞受体库分析与抗体序列演化研究。源站描述提及该数据可用于追踪免疫后B细胞受体库随时间的演化。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。实验对象为恒河猴(Macaca mulatta),共12只,均接种 V2-Apex 胚系靶向 Q23-APEX-GT2 免疫原。样本按免疫前与免疫后多个时间点采集,测序数据经过去多重化处理。数据在本站归入免疫系统疾病/其他分类。

【适用场景】

该数据集适用于免疫学与疫苗设计相关的研究场景,尤其是对胚系靶向免疫原诱导的B细胞受体库演化、抗体成熟过程的分析。由于研究关注抗体向广谱中和表位的发育方向,数据可用于探讨 V2-Apex 胚系靶向策略在HIV-1疫苗设计中的潜在价值。此外,纵向多时间点的设计使其适合开展免疫前后抗体序列变化的比较研究。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1229425

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含12只恒河猴(Macaca mulatta)经V2-Apex种系靶向Q23-APEX-GT2免疫原免疫后的去多重纵向抗体测序数据。该研究追踪了免疫后3个时间点和免疫前1个时间点的B细胞受体(BCR) repertoire演化,为免疫应答及抗体成熟进程提供了见解。这些数据有助于理解V2-Apex种系靶向策略在引导抗体向广谱中和表位发展方面的有效性,对HIV-1疫苗设计具有重要意义。

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