Anaerostipes caccae 菌株 LAHUC 分离株基因组测序

该数据集来自 NCBI,包含 Anaerostipes caccae 菌株 LAHUC 分离株的全基因组测序(WGS)与 16S rRNA 测序数据及相应组装结果(如有)

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基因组Genome sequencing
PRJNA1102404: Anaerostipes caccae strain:LAHUC | isolate:LAHUC Genome sequencing

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

Anaerostipes caccae 菌株 LAHUC 分离株基因组测序

该数据集来自 NCBI,围绕 Anaerostipes caccae 菌株 LAHUC 分离株的全基因组测序工作而建立,包含全基因组测序(WGS)与 16S rRNA 测序数据,以及相应的组装结果(如有)。数据集与 Hesser 等人 2024 年发表的“A butyrate-producing live biotherapeutic prevents and treats food allergy in mice”研究相关联,主题标签为 Genome sequencing,在站内分类中归入免疫系统疾病 / 其他。整体而言,该数据集为研究特定细菌菌株的基因组特征及其在相关免疫与过敏研究背景下的应用提供了测序层面的基础材料。

【数据集背景】

该数据集对应的研究背景是 Hesser 等人 2024 年发表的工作,题为“A butyrate-producing live biotherapeutic prevents and treats food allergy in mice”。从题名可以看出,该研究关注一种产丁酸的活体生物治疗制剂在小鼠食物过敏中的预防与治疗作用。Anaerostipes caccae 菌株 LAHUC 的基因组测序数据即在这一研究语境下产生,用于支撑对该菌株的认识。数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站描述中明确其收录了该研究相关的 WGS 与 16S rRNA 测序数据及相应组装结果(如有),记录时间为 2024-04-19。

【数据内容】

数据集包含两类测序数据:全基因组测序(WGS)数据与 16S rRNA 测序数据,并包含与这些数据相对应的组装结果(如有)。数据对象为 Anaerostipes caccae 菌株 LAHUC 的分离株。主题标签为 Genome sequencing,表明基因组测序是该数据集的核心内容类型。关于测序平台、读长、覆盖度、组装指标、样本数量等具体技术参数,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),属于该机构收录的测序数据记录。数据与 Hesser 等人 2024 年的研究直接关联,源站描述说明其汇集了该研究对应的 WGS 与 16S rRNA 测序数据及组装结果(如有)。关于样本采集地点、采集时间、分离来源、培养条件等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于围绕 Anaerostipes caccae 菌株 LAHUC 的基因组层面研究,例如查看该菌株的全基因组测序数据与 16S rRNA 测序数据,以及在有组装结果时使用相应组装。结合其关联研究,该数据也适合作为产丁酸活体生物治疗制剂与小鼠食物过敏研究背景下的菌株基因组参考资料。站内分类将其归入免疫系统疾病 / 其他,提示其可能服务于免疫相关疾病研究方向的数据检索与复用。关于具体的分析应用类型与下游用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 NCBI 收录的测序数据与组装结果形式提供,使用者可按 NCBI 的常规数据获取方式检索与下载。关于数据文件的具体组织方式、命名规则、下载入口与处理流程,源站未提供。

【质量与限制】

源站描述中注明组装结果“如有”(if available),说明并非所有数据都必然附带组装结果。关于数据质量评分、污染评估、组装完整性、测序深度等质量指标,源站未提供。使用时应以源站记录的实际内容为准。

【引用与许可】

该数据集关联 Hesser 等人 2024 年发表的论文“A butyrate-producing live biotherapeutic prevents and treats food allergy in mice”,使用时应引用该研究。关于数据的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1102404

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含Hesser等人2024年发表的“一种产丁酸活菌生物治疗药物可预防和治疗小鼠食物过敏”研究中的全基因组测序(WGS)和16s rRNA测序数据及其相应的组装结果(如有)。(2024-04-19)。

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