基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJEB57444：树坚果与花生食物过敏的miRNA生物标志物

PRJEB57444 是一个以 miRNA 测序为核心的数据集，英文全称为 miRNA Biomarkers of tree nut and peanut food allergy，聚焦树坚果与花生食物过敏的 miRNA 生物标志物研究。该数据集收录了接受树坚果与花生双盲安慰剂对照口服食物激发试验（DBPCFC）患者的 miRNA 测序数据，属于 CRU KFO 339 FOOD@ Project 大型研究的一部分。从分类上看，该数据集归入免疫系统疾病 / 其他类别，主题标签为 Other，来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，该数据集为食物过敏领域的分子层面研究提供了以 miRNA 表达谱为切入点的测序资源，可用于探索树坚果与花生过敏相关的潜在生物标志物。

【数据集背景】

食物过敏是免疫系统疾病中的重要类型，树坚果与花生过敏往往伴随终身，且存在严重过敏反应风险。口服食物激发试验是食物过敏诊断的重要方法，其中双盲安慰剂对照口服食物激发试验被广泛视为参考标准。该数据集正是在这一临床背景下产生，围绕接受树坚果与花生双盲安慰剂对照口服食物激发试验的患者展开 miRNA 测序，旨在从转录后调控层面寻找与食物过敏相关的 miRNA 生物标志物。该数据集是 CRU KFO 339 FOOD@ Project 大型研究的一部分，说明其数据生产嵌入在一个更广泛的食物过敏研究框架之中。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 miRNA 测序数据，样本来自接受树坚果与花生双盲安慰剂对照口服食物激发试验的患者。数据以 miRNA 测序结果为主体，反映患者在激发试验相关条件下的 miRNA 表达信息。除 miRNA 测序数据这一核心内容外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、数据文件格式、表达矩阵或临床变量表等更细化的描述。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。采集场景为患者接受树坚果与花生双盲安慰剂对照口服食物激发试验，测序对象为患者样本中的 miRNA。该数据集属于 CRU KFO 339 FOOD@ Project 大型研究的一部分。关于具体的样本采集时间点、采集部位、伦理审批信息以及测序文库构建流程，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于食物过敏相关的 miRNA 生物标志物研究，尤其是围绕树坚果与花生过敏的分子机制探索、候选 miRNA 标志物筛选与验证、以及与其他过敏相关组学数据的整合分析。由于数据来自双盲安慰剂对照口服食物激发试验场景，也可用于比较激发试验相关条件下 miRNA 表达变化的研究设计参考。关于该数据集是否适用于特定临床诊断模型构建或特定人群推断，源站未提供相应说明。

【使用方法】

该数据集以 miRNA 测序数据形式提供，使用时可按照 miRNA 测序数据的常规分析流程进行处理，包括测序质量控制、比对或注释、miRNA 表达定量以及差异表达分析等。由于源站未提供样本分组、临床表型字段与数据文件组织的详细说明，具体分析设计需结合原始数据记录进行确认。关于数据下载方式、文件命名规则与配套元数据表，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 CRU KFO 339 FOOD@ Project 的一部分，具有明确的研究背景与临床激发试验场景。但源站未提供样本量、测序深度、数据完整性、批次效应控制以及质量控制指标等信息，因此无法对数据质量作出具体评价。该数据集聚焦 miRNA 测序层面，源站未提供其他组学或临床终点数据的配套说明，使用时应以 miRNA 测序数据本身为限。此外，数据集主题标签为 Other，分类归入免疫系统疾病 / 其他，提示其在分类体系中并非独立细分条目。

【引用与许可】

该数据集来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJEB57444: miRNA Biomarkers of tree nut and peanut food allergy。关于具体的引用文献、数据访问许可条款与使用限制，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB57444

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB57444

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集呈现了接受树坚果和花生双盲安慰剂对照口服食物激发试验的患者的miRNA测序数据。该数据集是更大规模研究CRU KFO 339 FOOD@项目的一部分。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别