PRJEB37877:IgE介导食物过敏的过敏微生物特征

多项研究表明肠道菌群改变在食物过敏(FA)发生中起关键致病作用,但迄今尚无特定细菌分类群与FA一致相关。在此,我们表征了与IgE介导的FA状态相关的肠道菌群组成和SCFA谱

ena
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文本分类食物过敏肠道菌群IgE介导短链脂肪酸微生物特征免疫系统疾病
PRJEB37877: Allergic microbial signature in IgE-mediated food allergies

基本信息

模态
文本
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

PRJEB37877:IgE介导食物过敏的过敏微生物特征

PRJEB37877 数据集聚焦于 IgE 介导的食物过敏(FA)相关的肠道微生物特征,来源于 ebi.ac.uk。该数据集围绕肠道菌群组成与短链脂肪酸(SCFA)谱在 IgE 介导的食物过敏状态中的表现展开,纳入了 IgE 介导的 FA 患者与年龄匹配的对照组样本,旨在刻画与食物过敏相关的微生物组成差异。研究结果显示,过敏患者的微生物组组成与年龄匹配对照相比存在显著差异,并呈现出能够区分 FA 患者与健康非过敏对照的独特微生物特征,以及针对不同食物过敏的独特微生物特征。这些微生物差异被用于区分 FA 患者与非过敏性健康个体。该数据集属于免疫系统疾病 / 其他分类,可为食物过敏与肠道菌群关系的研究提供参考。

【数据集背景】

多项研究提示,肠道菌群的改变在食物过敏(FA)的发生中可能发挥关键致病作用,但迄今尚无特定细菌分类群与 FA 一致相关。在此背景下,该数据集所对应的研究致力于表征与 IgE 介导的 FA 状态相关的肠道菌群组成和 SCFA 谱,以探索食物过敏与肠道微生物之间的关联。研究关注的核心问题是:在 IgE 介导的食物过敏状态下,肠道菌群组成和 SCFA 谱呈现何种特征,这些特征是否能够区分过敏患者与健康非过敏对照,以及不同食物过敏是否具有不同的微生物特征。

【数据内容】

该数据集涉及对 IgE 介导的 FA 患者与年龄匹配对照组的血液和粪便样本进行分析。研究分析了 233 例 IgE 介导的 FA 患者以及年龄匹配的对照组(n=58)的血液和粪便样本。研究结果展示了 IgE 介导的 FA 与肠道菌群组成之间的联系,发现过敏患者的微生物组组成与年龄匹配对照相比存在显著差异,并呈现出能够区分 FA 患者与健康非过敏对照的独特微生物特征,以及针对不同食物过敏的独特微生物特征。这些微生物差异被用于区分 FA 患者与非过敏性健康个体。数据集英文名称为“PRJEB37877: Allergic microbial signature in IgE-mediated food allergies”,本站分类为免疫系统疾病 / 其他。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述显示,研究分析了来自 233 例 IgE 介导的 FA 患者和年龄匹配对照组(n=58)的血液与粪便样本,用于表征与 IgE 介导的 FA 状态相关的肠道菌群组成和 SCFA 谱。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及更详细的采集流程,源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集可用于研究与 IgE 介导的食物过敏相关的肠道微生物组成特征,比较食物过敏患者与年龄匹配健康非过敏对照之间的微生物组差异,探索不同食物过敏所对应的独特微生物特征,以及分析 SCFA 谱与 IgE 介导的 FA 状态之间的关联。此外,该数据集所呈现的微生物差异可用于区分 FA 患者与非过敏性健康个体,因而可能适用于食物过敏相关微生物标志物的探索性研究。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

源站描述提到,研究利用所发现的微生物差异来区分 FA 患者与非过敏性健康个体,并分析了血液和粪便样本中的肠道菌群组成与 SCFA 谱。关于数据的具体下载方式、文件格式、字段结构、分析流程或代码等使用层面的详细信息,源站未提供。

【质量与限制】

源站描述指出,此前尚无特定细菌分类群与 FA 一致相关,该研究则报告了 IgE 介导的 FA 与肠道菌群组成之间的联系,并发现过敏患者与年龄匹配对照之间存在显著不同的微生物特征。研究纳入了 233 例 IgE 介导的 FA 患者和 58 例年龄匹配对照。关于该数据集的样本质量评估、批次效应、测序深度、数据完整性以及其它潜在限制,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB37877

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

多项研究提示,肠道菌群改变在食物过敏(FA)发生中起关键致病作用,但迄今为止,尚无特定细菌分类群与FA consistently相关。在此,我们表征了与IgE介导的FA状态相关的肠道菌群组成及SCFA谱。我们分析了233例IgE介导的FA患者及年龄匹配对照组(n=58)的血液和粪便样本。我们的结果证明IgE介导的FA与肠道菌群组成之间存在关联。我们发现,过敏患者的微生物组组成与年龄匹配对照显著不同,具有可将FA患者与健康非过敏对照区分开的独特微生物特征,并且FA对不同食物的独特微生物特征。我们利用这些微生物差异以85%的准确率区分FA患者与非过敏性健康对照,并使用监督学习算法根据FA类型对FA患者进行分类。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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