PRJEB35475：中国健康人群与痤疮患者微生物多样性
目的 从16SrRNA对痤疮患者与健康志愿者之间的微生物物种鉴定和多样性进行分析，以复方黄柏液治疗，并观察治疗前与治疗后微生物群落的差异
基本信息
资源简介
PRJEB35475：中国健康人群与痤疮患者微生物多样性
PRJEB35475 是一项聚焦于面部皮肤微生物组的测序研究数据集，全称为“Microbial Diversity in Chinese Healthy and Patients with Acne”，即中国健康人群与痤疮患者微生物多样性研究。该数据集围绕痤疮这一免疫系统相关疾病，通过 16SrRNA 测序手段，对健康志愿者与轻中度痤疮患者的面部皮肤微生物群落进行物种鉴定与多样性分析，并进一步观察以复方黄柏液治疗前后微生物群落所发生的变化。研究共对 46 份样本进行测序，涵盖患者组、治疗后复采组以及健康组，获得了大量序列与 OTU 数据，揭示了痤疮患者面部皮肤中特定微生物的显著影响。该数据集为探索痤疮与皮肤微生态之间的关系、评估中药复方治疗对微生物群落的调节作用提供了可用的测序资源。
【数据集背景】
痤疮是一种常见的慢性炎症性皮肤疾病，其发生发展与皮肤微生物群落的组成和多样性密切相关。该数据集所依托的研究，旨在从 16SrRNA 层面开展痤疮患者与健康志愿者之间的微生物物种鉴定和多样性分析，并在此基础上引入复方黄柏液治疗，观察治疗前与治疗后微生物群落之间的差异。研究关注的核心问题包括：轻中度痤疮患者面部皮肤微生物群落与健康人群存在何种差异，以及复方黄柏液干预后群落结构是否发生改变。该数据集所属分类为免疫系统疾病 / 其他，来源站为 ebi.ac.uk。
【数据内容】
该数据集来源于对 46 份样本的测序，具体分组为：患者组 19 例，治疗后复采 17 例（其中 2 例脱落），健康组 10 例。测序共获得 3,680,481 条序列和 7125 个 OTU。研究结果显示，痤疮丙酸杆菌（Propionibacterium）与金黄色葡萄球菌（Staphylococcus Aureus）对轻中度痤疮患者面部皮肤具有显著影响。上述内容构成了该数据集在样本规模、测序产出和主要发现方面的核心信息。
【采集与来源】
该数据集的样本采集方式为采集健康志愿者与轻中度痤疮患者的面部拭子，并在治疗前后分别取样。研究通过高通量测序与基因组注释获得面部皮肤微生物群落的物种组成与丰度信息。数据来源站为 ebi.ac.uk。关于样本采集的具体时间跨度、地理区域、受试者纳入排除标准等更细粒度的采集信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于皮肤微生物组与痤疮相关的研究场景，包括但不限于：比较痤疮患者与健康人群面部皮肤微生物多样性与物种组成的差异；分析复方黄柏液治疗前后微生物群落的变化；围绕痤疮丙酸杆菌、金黄色葡萄球菌等关键物种开展进一步的功能或关联分析；以及作为 16SrRNA 皮肤微生物组研究的参考数据，用于方法学比较或荟萃分析。其分类归属为免疫系统疾病 / 其他，也可供免疫相关皮肤疾病微生态研究参考。
【使用方法】
该数据集以 16SrRNA 高通量测序与基因组注释产生的序列及 OTU 数据为基础，使用者可依据样本分组信息（患者组、治疗后复采组、健康组）开展群落多样性分析、物种组成与丰度比较，以及治疗前后差异分析。由于数据来源于面部拭子，分析时需注意样本类型的一致性。关于数据的具体下载方式、文件格式、分析流程与参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集共测序 46 份样本，其中治疗后复采组存在 2 例脱落，实际复采 17 例。研究获得了 3,680,481 条序列和 7125 个 OTU，样本量与测序产出在源站描述中已有明确记录。需要指出的是，源站描述在健康个体相关表述处未完整给出，因此关于健康组微生物特征的完整结论，源站未提供。此外，关于测序平台型号、读长、质控标准、批次效应、受试者人口学信息及临床评分细节等，源站未提供，使用时应结合原始研究文献加以核实。
【引用与许可】
该数据集英文名称为“PRJEB35475: Microbial Diversity in Chinese Healthy and Patients with Acne”，来源站为 ebi.ac.uk。关于该数据集的具体引用格式、许可协议与使用条款，源站未提供，使用者在引用与再利用前应查阅源站页面获取正式说明。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB35475
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目的 通过16SrRNA对痤疮患者与健康志愿者进行微生物物种鉴定和多样性分析，采用复方黄柏液治疗，并观察治疗前后微生物群落差异。方法 采集健康志愿者及轻中度痤疮患者治疗前后的面部拭子，通过高通量测序和基因组注释获得面部皮肤微生物群落物种及丰度。结果 对46份样本进行测序，其中患者组19例，治疗后复采17例（2例脱落），健康组10例，共获得3，680，481条序列和7125个OTUs。结果显示，痤疮丙酸杆菌和金黄色葡萄球菌对轻中度痤疮患者面部皮肤有显著影响。在健康个体中，α-变形菌纲、β-变形菌纲的奈瑟菌属以及γ-变形菌纲的奥斯陆莫拉菌和巨型弧菌菌株较为显著。痤疮患者与健康志愿者的微生物在丰度和组成上存在显著差异。
复方黄柏液治疗后，痤疮患者面部皮肤微生物组发生显著变化，并逐渐趋近于健康人群。结论：奥斯陆莫拉菌和巨大弧菌是中国人群面部表面的主要常驻菌群，在微生物丰度分析中，健康人群显著高于痤疮患者。中国人群面部表面微生物群落可能与其他种族不同。健康人群在生物多样性和丰度分析中均高于痤疮患者。皮肤微生态的平衡可能是皮肤正常免疫功能的一部分。复方黄柏液能显著改善轻中度痤疮患者的面部微生物群落。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
