抗干扰素γ自身抗体相关疾病的血浆宏基因组二代测序

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1516990),英文名为 PRJEB123949,主题为抗干扰素γ自身抗体相关疾病(AIGA)的血浆宏基因组二代测序(mNGS)

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基因组分类Other
PRJEB123949: Plasma metagenomic next-generation sequencing in anti-interferon-gamma autoantibody-associated disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

抗干扰素γ自身抗体相关疾病的血浆宏基因组二代测序

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1516990,英文名称为 PRJEB123949,标题为“Plasma metagenomic next-generation sequencing in anti-interferon-gamma autoantibody-associated disease”,中文可译为“抗干扰素γ自身抗体相关疾病中的血浆宏基因组二代测序”。从分类上看,它被归入免疫系统疾病 / 其他类别,主题标签为 Other。该项目的核心对象是抗干扰素γ自身抗体相关疾病(AIGA)患者血浆样本的宏基因组二代测序数据,旨在通过 BioProject 这一统一入口,汇集与该研究计划相关的多种生物数据类型。整体而言,这是一个以疾病相关血浆 mNGS 为技术路线的生物项目记录,面向免疫系统疾病领域的研究者,提供可检索、可链接的项目级数据资源入口。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject,项目编号为 1516990,英文名称 PRJEB123949。BioProject 是围绕某一项单一研究计划而组织的生物数据集合,通常由单一机构或联合体发起。一个 BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,用以查找该项目所产生的多种数据类型及其相关链接。本项目聚焦于抗干扰素γ自身抗体相关疾病(AIGA),并采用血浆宏基因组二代测序(mNGS)作为核心技术手段,属于免疫系统疾病 / 其他分类下的研究资源。

【数据内容】

该数据集的主题为 AIGA 相关疾病中的血浆宏基因组二代测序。其英文名称明确指向“Plasma metagenomic next-generation sequencing”,即血浆样本的宏基因组二代测序。BioProject 记录本身并不限定单一数据类型,而是汇集与该项目相关的多种生物数据。关于具体的样本数量、测序读长、数据量、文件格式、分析结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“AIGA-plasma-mNGS (ID 1516990) - BioProject - NCBI”。项目记录由 NCBI BioProject 数据库承载,项目编号为 1516990。关于样本采集地点、采集时间、受试者招募方式、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于免疫系统疾病领域,尤其是与抗干扰素γ自身抗体相关疾病(AIGA)相关的研究场景。由于采用血浆宏基因组二代测序,其潜在应用方向包括对血浆中微生物核酸成分的检测与分析,以及围绕 AIGA 疾病背景开展的宏基因组研究。BioProject 作为项目级入口,也可用于查找与该研究计划相关的多种数据类型。关于具体的分析流程、临床诊断用途或验证性应用,源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以项目编号 1516990 或英文名称 PRJEB123949 进行检索与访问。BioProject 记录提供统一入口,用于链接该项目产生的多种数据类型。关于数据下载方式、访问权限、是否需要申请、配套分析工具或流程等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集以 BioProject 记录形式发布,提供项目级的数据组织与链接入口。关于数据质量指标、测序深度、覆盖度、污染控制、批次效应、样本纳入排除标准等,源站未提供。使用时应以源站记录的实际内容为准,并注意 BioProject 记录本身是对项目的描述性入口,而非对具体数据质量的评价。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“AIGA-plasma-mNGS (ID 1516990) - BioProject - NCBI”。关于引用格式、许可条款、使用限制或数据共享协议等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB123949

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对来自台湾大学医院招募的36例未接受免疫治疗的抗干扰素-γ自身抗体(AIGA)相关疾病成年患者的59份标本,进行了去除宿主血浆游离DNA的宏基因组下一代测序(mNGS)。该数据集包括每位患者的一份基线标本,以及来自23例具有裁定临床结局的患者的配对随访标本。在数据提交前已去除人类宿主序列读段。

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