基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

系统性硬化症、雷诺现象与健康对照血清miRNA小RNA测序分析

该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项小 RNA 测序项目，英文名称为 PRJEB111176: Small RNA-seq analysis of serum miRNAs from patients with systemic sclerosis, Raynaud’s phenomenon, and healthy controls，源站记录 ID 为 1450415。从名称与描述可知，该项目围绕系统性硬化症患者、雷诺现象患者以及健康对照者的血清 miRNA 开展小 RNA 测序分析，属于免疫系统疾病相关研究范畴。BioProject 作为生物数据的集合性记录，旨在将同一研究计划下产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找与访问。该数据集在主题标签上归为 Other，本站分类为免疫系统疾病 / 其他，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

系统性硬化症是一种与免疫系统相关的疾病，雷诺现象则常与血管功能异常相关，二者在临床与基础研究中均受到关注。该数据集以血清 miRNA 为研究对象，通过小 RNA 测序手段，对系统性硬化症患者、雷诺现象患者及健康对照者进行对比分析。此类研究通常用于探索循环 miRNA 在疾病状态下的表达差异，进而为疾病机制理解、生物标志物发现等方向提供数据基础。该数据集来源于 NCBI BioProject，属于单一研究计划下的生物数据集合，其记录形式有助于将同一项目产生的不同类型数据集中呈现，方便研究者定位与获取。

【数据内容】

该数据集的核心内容为血清 miRNA 的小 RNA 测序分析，涉及三类样本来源：系统性硬化症患者、雷诺现象患者以及健康对照者。数据集英文名称明确指向 serum miRNAs，说明研究对象为血清中的 miRNA。关于样本数量、测序平台、读长、测序深度、具体 miRNA 种类或表达矩阵等细节，源站未提供。该数据集在主题标签上标注为 Other，本站分类归入免疫系统疾病 / 其他，提示其与免疫系统疾病研究相关，但具体分类依据与细分方向源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示为 Small RNA-seq analysis of serum miRNAs from patien... (ID 1450415) - BioProject - NCBI。其 BioProject 记录 ID 为 1450415，英文名称为 PRJEB111176。BioProject 作为生物数据的集合，通常来自单一组织或联盟发起的研究计划，并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者招募标准等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于与系统性硬化症、雷诺现象相关的血清 miRNA 研究场景，例如比较患者与健康对照之间 miRNA 表达差异的探索性分析，或作为小 RNA 测序数据用于方法学验证与二次分析。由于涉及免疫系统疾病分类，也可能适用于免疫相关疾病中循环 miRNA 特征的研究。具体适用场景需结合源站记录及原始研究设计判断，源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

该数据集以 NCBI BioProject 记录形式提供，用户可通过 BioProject ID 1450415 或英文名称 PRJEB111176 在 NCBI 站点查找该项目，并通过记录中的链接访问该项目产生的不同类型数据。关于数据下载方式、文件格式、分析流程、参考基因组或注释版本等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共生物数据资源。关于数据质量评估、测序质量指标、样本排除标准、批次效应、技术重复等信息，源站未提供。由于源站描述为 BioProject 的通用说明，未给出该项目的具体质量控制细节，因此在使用时需结合原始项目记录进一步确认。该数据集的主题标签为 Other，分类为免疫系统疾病 / 其他，可能意味着其主题归类并不十分细化，具体研究边界需参考源站记录。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或数据共享政策，源站未提供。用户在使用时应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关规定，并参考源站记录中可能提供的引用要求。由于源站未提供具体许可信息，无法确认其是否允许再分发或商业使用。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB111176

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB111176

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

系统性硬化症（SSc）是一种复杂的自身免疫性疾病，以微血管功能障碍、免疫失调和进行性纤维化为特征，可分为局限性皮肤型（lcSSc）和弥漫性皮肤型（dcSSc）。原发性雷诺现象（RP）是一种功能性血管疾病，可先于结缔组织病出现或独立发生。循环microRNA（miRNA）已成为血管和免疫过程的调控因子，并可在血清中检测到。本研究评估了SSc患者（包括lcSSc和dcSSc亚型）、RP患者及健康对照者的血清miRNA谱。在发现队列中进行了小RNA测序，以表征各研究组间循环miRNA的表达特征。从血清来源的RNA制备文库，并在Illumina平台上进行测序。原始测序数据通过标准化流程进行miRNA定量处理，并生成归一化计数用于下游分析。该数据集为探索SSc亚型和RP中的循环miRNA谱提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别