自身免疫性肝炎中的NGS免疫测序数据

源站描述指出,下一代免疫测序揭示了自身免疫性肝炎中病理性的T细胞结构。数据围绕自身免疫性肝炎的免疫组库测序展开,可用于研究该疾病中T细胞克隆组成与病理架构,支撑免疫系统疾病的基因组学分析与探索(来源 omicsdi.org)

omicsdi
浏览 9
基因组分类Genomics
NGS in Autoimmune Hepatitis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

自身免疫性肝炎中的NGS免疫测序数据

NGS in Autoimmune Hepatitis 是一个面向自身免疫性肝炎研究的免疫组库测序数据集,英文名称即为 NGS in Autoimmune Hepatitis,在分类上归属于免疫系统疾病下的其他类别,来源站为 omicsdi.org,主题标签为 Genomics。该数据集围绕自身免疫性肝炎的下一代免疫测序展开,其源站描述指出,下一代免疫测序揭示了自身免疫性肝炎中病理性的 T 细胞结构。借助免疫组库测序数据,研究者可以考察该疾病中 T 细胞的克隆组成与病理架构,为免疫系统疾病的基因组学分析与探索提供数据支撑。整体而言,该数据集以基因组学为切入点,将免疫测序与自身免疫性肝炎的病理特征联系起来,适合用于探索 T 细胞在疾病状态下的组成特征与结构规律。

【数据集背景】

自身免疫性肝炎是一种免疫系统疾病,本数据集在分类体系中即归入免疫系统疾病 / 其他。数据集的源站描述为“Next-generation immunosequencing reveals pathological T cell architecture in autoimmune hepatitis”,即下一代免疫测序揭示自身免疫性肝炎中病理性的 T 细胞结构。这一描述点明了数据集的核心背景:以免疫测序手段观察自身免疫性肝炎中 T 细胞的病理架构。数据集的主题标签为 Genomics,说明其数据性质属于基因组学范畴,关注的是免疫组库层面的序列信息,而非其他类型的临床或影像资料。

【数据内容】

数据集围绕自身免疫性肝炎的免疫组库测序展开,可用于研究该疾病中 T 细胞克隆组成与病理架构。其内容指向下一代免疫测序所获得的免疫组库数据,关注 T 细胞的克隆组成及其在病理状态下的结构特征。关于具体的样本数量、测序平台、序列读长、克隆型数目等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述给出了数据集的核心研究主题,即下一代免疫测序与自身免疫性肝炎中病理性 T 细胞结构之间的关系。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

依据其主题与描述,该数据集适用于免疫系统疾病特别是自身免疫性肝炎相关的基因组学分析与探索,可用于研究该疾病中 T 细胞克隆组成与病理架构,支撑对病理性 T 细胞结构的考察。关于具体的分析流程、对照设置或临床转化应用,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

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使用方式

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源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJEB37143

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Next-generation immunosequencing reveals pathological T cell architecture in autoimmune hepatitis

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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