健康与免疫缺陷谱系中免疫细胞图谱及疫苗应答的CITE-seq数据集
数据聚焦健康与免疫缺陷状态下免疫细胞图谱及疫苗应答的CITE-seq测量，可用于研究不同免疫状态下细胞组成与疫苗反应差异
![Mapping immune cellular landscapes and vaccine responses across a spectrum of health and immunodeficiency [CITE-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/136884.jpg)
基本信息
资源简介
健康与免疫缺陷谱系中免疫细胞图谱及疫苗应答的CITE-seq数据集
该数据集英文名为 Mapping immune cellular landscapes and vaccine responses across a spectrum of health and immunodeficiency [CITE-seq]，在站内归入免疫系统疾病 / 其他分类，来源站为 omicsdi.org，主题标签为 Genomics。数据集聚焦健康与免疫缺陷状态下免疫细胞图谱及疫苗应答的 CITE-seq 测量，可用于研究不同免疫状态下细胞组成与疫苗反应差异。整体来看，它围绕“健康—免疫缺陷”这一连续谱系，借助 CITE-seq 技术同时获取免疫细胞的转录组信息与表面蛋白信息，为刻画免疫细胞组成、比较不同免疫状态下的细胞图谱以及观察疫苗应答差异提供数据基础。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面作进一步说明。
【数据集背景】
免疫系统疾病涉及免疫功能的多种异常状态，健康个体与免疫缺陷个体在免疫细胞组成和对外源抗原（如疫苗）的应答上可能存在差异。要在细胞层面理解这些差异，需要在同一技术框架下对多类样本进行测量。该数据集以“健康与免疫缺陷连续谱系”为组织思路，将免疫细胞图谱刻画与疫苗应答观察结合起来，主题标签为 Genomics，站内分类为免疫系统疾病 / 其他。其英文名称直接点明了研究范围：跨越健康与免疫缺陷谱系，绘制免疫细胞图谱并观察疫苗应答，测量手段为 CITE-seq。
【数据内容】
数据集的核心内容是健康与免疫缺陷状态下免疫细胞图谱及疫苗应答的 CITE-seq 测量结果。CITE-seq 属于单细胞层面的联合测量技术，可在获取细胞转录组信息的同时获取表面蛋白信息，因此该数据集可用于研究不同免疫状态下的细胞组成，以及疫苗反应的差异。主题标签为 Genomics，说明其数据组织与基因组学测量相关。除上述范围性描述外，源站未提供关于样本数量、测序深度、标记基因列表、细胞类型注释等更细的内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，源站描述与其英文名称一致，即 Mapping immune cellular landscapes and vaccine responses across a spectrum of health and immunodeficiency [CITE-seq]。站内将其归入免疫系统疾病 / 其他分类。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息以及原始数据产生机构等，源站未提供。
【适用场景】
依据其主题与测量类型，该数据集适用于研究不同免疫状态下免疫细胞组成的差异，比较健康个体与免疫缺陷个体在疫苗应答上的细胞层面表现，以及围绕免疫细胞图谱开展探索性分析。主题标签 Genomics 表明其可服务于基因组学相关的研究语境。需要说明的是，具体可支持的统计比较或建模方式，源站未提供明确说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方式，包括数据下载格式、文件组织、配套分析流程或代码等。使用者需依据来源站 omicsdi.org 的条目信息自行确认获取途径与使用条件。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、批次效应、缺失情况或技术限制的说明。由于数据集覆盖健康与免疫缺陷的连续谱系，不同免疫状态样本之间的可比性需在使用时自行评估，但源站未给出相关指引。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可条款信息。使用前应向来源站 omicsdi.org 查询确认。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA1475356
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Mapping immune cellular landscapes and vaccine responses across a spectrum of health and immunodeficiency [CITE-seq]
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
