危地马拉狼疮性肾炎患者数据集

该数据集来自危地马拉一项针对29名狼疮性肾炎患者的研究,包含HLA-DRB1和HLA-DQB1基因等位基因信息,均为低分辨率等位基因(仅单字段)

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基因组分类Medicine, Health and Life Sciences
Lupus Nephritis Patients from Guatemala

基本信息

模态
基因组
大小
0.00000326 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

危地马拉狼疮性肾炎患者数据集

Lupus Nephritis Patients from Guatemala 是一个聚焦于狼疮性肾炎患者人类白细胞抗原(HLA)基因等位基因信息的数据集,来源于危地马拉开展的一项针对29名狼疮性肾炎患者的研究。该数据集收录了受试者 HLA-DRB1 与 HLA-DQB1 两个基因位点的等位基因数据,且所有等位基因均以低分辨率形式呈现,即仅保留单字段水平的等位基因信息。数据集由 Barrios Menéndez, Juan Carlos 提交,托管于 Harvard Dataverse,发布时间为2026年,主题归属于医学、健康与生命科学领域,在疾病分类上属于免疫系统疾病下的其他类别。整体而言,该数据集为研究危地马拉人群狼疮性肾炎与特定 HLA 等位基因之间可能存在的关联提供了基础性的遗传学资料。

【数据集背景】

狼疮性肾炎是系统性红斑狼疮累及肾脏的严重并发症,其发生与遗传易感性密切相关,其中 HLA 区域尤其是 HLA-DRB1 和 HLA-DQB1 位点的等位基因变异被广泛关注。该数据集即诞生于危地马拉开展的一项针对狼疮性肾炎患者的遗传学研究,旨在记录并公开这批患者的 HLA 等位基因分型结果,为后续免疫遗传学研究和人群比较提供可复用的数据基础。数据集所属分类为免疫系统疾病 / 其他,主题标签为 Medicine, Health and Life Sciences。

【数据内容】

数据集包含来自29名狼疮性肾炎患者的 HLA-DRB1 和 HLA-DQB1 基因等位基因信息。所有等位基因均为低分辨率结果,即仅提供单字段水平的等位基因命名,不包含更高分辨率的字段信息。数据覆盖的两个基因位点均属于 HLA II 类区域,与免疫应答和自身免疫性疾病易感性相关。除上述基因位点与分辨率水平外,源站未提供关于具体等位基因种类、频率分布或样本人口学特征的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于危地马拉开展的一项针对狼疮性肾炎患者的研究,由 Barrios Menéndez, Juan Carlos 作为作者提交,托管机构为 Harvard Dataverse,来源站为 doi.org,发布时间为2026年。源站未提供关于样本采集地点、采集时间、分型实验方法或伦理审批等方面的具体信息。

【适用场景】

基于其内容,该数据集可用于免疫遗传学领域的基础研究,例如探讨 HLA-DRB1 与 HLA-DQB1 低分辨率等位基因在狼疮性肾炎患者中的分布情况,或作为危地马拉人群 HLA 等位基因资料的参考。也可用于跨人群的初步比较研究以及方法学教学中作为示例数据。由于仅含低分辨率等位基因信息,其适用场景限于不需要高分辨率分型的研究目的。源站未提供关于数据具体应用案例的说明。

【使用方法】

源站未提供关于数据文件格式、组织结构、下载方式或分析工具的具体说明。使用者需依据 Harvard Dataverse 平台的一般访问流程获取数据。源站未提供推荐的分析方法或使用指南。

【质量与限制】

该数据集的主要限制在于等位基因分辨率较低,仅为单字段水平,无法支持需要精确到具体等位基因亚型的研究。样本量为29名患者,规模有限。源站未提供关于数据质量控制、缺失值处理、验证方法或重复样本核查等方面的信息。此外,源站未提供样本的临床特征、人群背景或对照数据,可能限制因果性或关联性推断的强度。

【引用与许可】

源站未提供关于数据引用格式或使用许可条款的具体信息。使用者在引用或再利用该数据集时,应参照 Harvard Dataverse 平台的相关规定及作者信息进行规范引用。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.7910/DVN/XSOIZX

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 3.3 KB。

数据说明

这是一个数据集,包含来自一项在危地马拉29名狼疮性肾炎患者中开展的研究的HLA-DRB1和HLA-DQB1基因等位基因。它包含低分辨率等位基因(仅单字段)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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