wbbL突变导致O-抗原缺失在大肠杆菌血流感染中常见且与死亡率升高相关

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE319702

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

大肠杆菌血流感染较为常见，且与高死亡率相关。大肠杆菌的一个关键特征是脂多糖（LPS）O-抗原，其在侵袭性感染过程中有助于免疫逃逸。我们分析了复发菌血症患者的系列大肠杆菌分离株，发现由于wbbL突变导致O-抗原合成频繁中断，从而产生粗糙型LPS（R-LPS）表型。具有粗糙型LPS的大肠杆菌分离株对血清更为敏感，在小鼠中致病性较低。尽管存在这种明显的减毒现象，我们队列中66株大肠杆菌序列型131血流分离株中有11株（18%）缺乏O-抗原，并与显著更差的临床结局相关，包括感染性休克和死亡。利用复发性菌血症模型，我们证明R-LPS分离株可部分逃逸针对光滑型LPS大肠杆菌产生的保护性免疫，突显了宿主免疫背景在侵袭性疾病中的重要性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。