CDI长期结局：FMT与仅抗生素治疗对比

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07569380

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：艰难梭菌感染。研究设计与环境 这是一项在瑞典于默奥大学医院感染科开展的单中心、长期观察性队列研究。研究纳入2016年2月1日至2024年12月31日期间接受CDI治疗的成年患者，从索引CDI发作起提供最长10年的随访。参与者被分为两组：FMT治疗组和仅抗生素治疗组。CDI病例定义 符合临床表现（24小时内≥3次稀便）加上艰难梭菌核酸检测（LAMP）阳性，与ESCMID诊断标准一致。招募 从科室诊断记录中识别可能符合条件的在世受试者，并通过邮件联系，附上书面研究信息和退出表。未退回退出表者将通过电话联系，并邀请其参加一次研究访视以获取知情同意并入组。 deceased个体仅纳入安全性分析，不与近亲属联系。

生物样本采集 血液：EDTA血浆、血清、PBMC分离 粪便样本 尿液样本 鼻咽拭子 将调取乌默奥FMT生物样本库中存档的供者粪便样本以及患者FMT前后的样本，用于纵向比较。观察性指标 肠道和鼻咽微生物群将通过鸟枪法宏基因组学（菌株水平分辨率）和16S rRNA测序进行表征。将在粪便样本上进行耐药基因组分析和多重耐药菌的培养检测。将在粪便、尿液和血液上进行全局和靶向代谢组学分析（短链脂肪酸、胆汁酸、氧化还原代谢物）。血液中的肠道屏障标志物将包括LPS、LPS结合蛋白（LBP）和EndoCAb。系统性免疫分析将包括细胞因子组合、可溶性免疫介质、抗体以及外周血单核细胞的转录组分析。不会对宿主基因组进行测序。临床观察性指标

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。