巴基斯坦与印度两个南亚队列的免疫遗传多样性数据

该数据集来自 Harvard Dataverse,包含巴基斯坦与印度两个南亚队列去标识化受试者的靶向 KIR 与 HLA I 类序列读段,属于免疫系统疾病相关数据

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dataverse
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基因组Medicine, Health and Life SciencesImmunogenetics
Immunogenetic diversity of two South Asian cohorts, from Pakistan and India

基本信息

模态
基因组
大小
24.593933625 GB
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

巴基斯坦与印度两个南亚队列的免疫遗传多样性数据

该数据集题为“Immunogenetic diversity of two South Asian cohorts, from Pakistan and India”,由 Kichula, Katherine 与 Norman, Paul 两位作者贡献,收录于 Harvard Dataverse,发布时间为 2026 年。数据集聚焦南亚地区巴基斯坦与印度两个队列的免疫遗传学多样性,内容为去标识化受试者的靶向 KIR 与 HLA I 类序列读段。按本站分类,该数据归入免疫系统疾病 / 其他类别,主题标签涵盖医学、健康与生命科学以及免疫遗传学。源站说明,如需获取访问权限,需联系数据存放者。整体而言,这是一份面向免疫遗传学研究、以序列读段为核心内容的受控访问数据集,适合关注南亚人群免疫基因多样性的研究者了解与申请使用。

【数据集背景】

免疫遗传学关注个体免疫相关基因的组成与变异,其中 KIR(杀伤细胞免疫球蛋白样受体)基因与 HLA I 类基因是研究天然免疫识别与适应性免疫应答的重要对象。不同人群在这些基因位点上往往呈现显著差异,因此针对特定地域队列的序列数据具有人群特异性研究价值。该数据集以巴基斯坦与印度两个南亚队列为对象,围绕 KIR 与 HLA I 类区域开展靶向测序,旨在呈现这两个南亚人群的免疫遗传多样性。数据集发布于 Harvard Dataverse,属于医学、健康与生命科学领域,并与免疫系统疾病方向相关联。

【数据内容】

数据集的核心内容是去标识化受试者的靶向 KIR 与 HLA I 类序列读段。所谓靶向,指测序范围集中于 KIR 与 HLA I 类相关区域,而非全基因组或全外显子范围;所谓序列读段,指测序产生的短序列片段数据。数据覆盖巴基斯坦与印度两个南亚队列的受试者,受试者身份信息已做去标识化处理。除上述内容外,源站未提供关于样本数量、读段长度、测序平台、文件格式及数据体量的进一步说明。

【采集与来源】

数据来源于 doi.org 所指向的存放位置,由 Harvard Dataverse 机构收录,作者为 Kichula, Katherine 与 Norman, Paul,发布年份为 2026 年。源站描述表明,数据为去标识化受试者的靶向 KIR 与 HLA I 类序列读段,访问需联系数据存放者申请。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及测序具体流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容特征,该数据集可用于南亚人群 KIR 与 HLA I 类基因多样性的比较分析,也可为免疫遗传学中人群差异相关的研究提供序列层面的参考。由于数据与免疫系统疾病分类相关联,相关领域的研究者在探讨免疫基因组成与疾病关联时,可能将其作为人群背景数据使用。具体适用场景的详细说明,源站未提供。

【使用方法】

源站明确说明,如需请求访问,请联系数据存放者。除这一受控访问方式外,源站未提供关于数据下载格式、分析流程、配套工具或使用协议的具体指引。

【质量与限制】

数据为去标识化受试者的靶向序列读段,覆盖巴基斯坦与印度两个南亚队列。关于数据质量评估、覆盖度、缺失情况、批次效应及样本代表性等信息,源站未提供。使用者应注意该数据为受控访问资源,需经申请方可获取。

【引用与许可】

数据作者为 Kichula, Katherine 与 Norman, Paul,收录机构为 Harvard Dataverse,发布年份为 2026 年。关于引用格式、许可条款及使用限制的具体内容,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.7910/DVN/OVCBVZ

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 24.59 GB。

数据说明

Targeted KIR, and HLA class I sequence reads from de-identified subjects. To request access please contact the data depositor.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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