新生儿髓系细胞与T细胞免疫应答eQTL研究
该数据集来自omicsdi.org，包含152名个体出生时脐带血样本中静息及刺激后髓系细胞和CD4+ T细胞的基因表达微阵列数据，刺激条件为LPS或PHA处理24小时
基本信息
资源简介
新生儿髓系细胞与T细胞免疫应答eQTL研究
该数据集英文名为 Immune response eQTL study in human neonatal myeloid cells and T cells，来源于 omicsdi.org，主题标签为 Transcriptomics，在本站归入免疫系统疾病 / 其他分类。数据集围绕出生时脐带血样本中的免疫细胞展开，包含 152 名个体静息状态及刺激后髓系细胞与 CD4+ T 细胞的基因表达微阵列数据，刺激条件分别为脂多糖（LPS）或植物血凝素（PHA）处理 24 小时。数据覆盖原始阵列数据、分位数归一化后的基因表达数据，以及 eQTL 分析和应答 eQTL 交互检验的完整汇总统计结果，可用于研究新生儿免疫细胞基因表达的遗传调控及其对刺激应答的差异。
【数据集背景】
免疫应答相关基因表达的遗传调控是理解个体间免疫差异的重要切入点。该数据集聚焦人类新生儿期，以出生时脐带血为生物材料，针对髓系细胞和 CD4+ T 细胞两类关键免疫细胞，在静息状态与体外刺激条件下开展表达数量性状位点（eQTL）研究。其设计意图在于同时刻画基础状态下的基因表达调控，以及免疫刺激后表达应答的遗传基础，即应答 eQTL。数据集主题标签为 Transcriptomics，属于转录组层面的遗传调控研究资源。
【数据内容】
数据集包含静息髓系细胞、静息 CD4+ T 细胞，以及分别经 LPS 或 PHA 刺激 24 小时后的对应细胞样本的基因表达微阵列数据。可获取的数据类型包括原始阵列数据和经过分位数归一化的基因表达数据。此外，还提供 eQTL 分析的完整汇总统计结果，以及针对应答 eQTL 的交互检验汇总统计。样本属性与实验变量等信息记录在名为“Microarray_sample_info.txt”的文件中。
【采集与来源】
样本来自 152 名个体出生时的脐带血。研究人员从静息及刺激后的外周血单个核细胞中纯化获得髓系细胞与 CD4+ T 细胞，刺激条件为 LPS 或 PHA 处理 24 小时。数据来源站为 omicsdi.org。
【适用场景】
该数据集适用于转录组学与免疫遗传学相关研究，例如分析新生儿免疫细胞中基因表达的顺式或反式调控信号、比较静息与刺激状态下 eQTL 的差异、识别免疫应答相关的基因—表达调控关系，以及作为免疫细胞刺激实验表达数据分析的参考资源。其 eQTL 汇总统计也可用于与其他人群或细胞类型研究的比较分析。
【使用方法】
使用者可结合分位数归一化后的基因表达数据与样本信息文件开展表达水平分析；利用提供的 eQTL 汇总统计进行遗传调控信号的检索与整合；利用应答 eQTL 交互检验统计评估刺激条件对表达调控效应的影响。原始阵列数据可用于重新执行预处理或采用不同的归一化策略。具体分析流程与参数设置源站未提供。
【质量与限制】
样本量、细胞类型、刺激条件与时间点均已明确，且同时提供原始数据与归一化数据，便于复现与比较。但数据集仅涉及出生时脐带血来源的新生儿样本，细胞类型限于髓系细胞与 CD4+ T 细胞，刺激条件限于 LPS 与 PHA 处理 24 小时。关于数据质量评估指标、批次信息及缺失值情况，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-8977
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
静息状态髓系细胞和CD4+ T细胞的基因表达微阵列数据，以及分别经脂多糖（LPS）或植物血凝素（PHA）刺激24小时后的数据。髓系细胞和CD4+ T细胞从152名个体出生时脐带血样本的静息及刺激后外周血单个核细胞中纯化获得。原始芯片数据和分位数归一化基因表达数据均可获取。eQTL分析的完整汇总统计量及应答eQTL交互检验结果均可获取。样本属性和实验变量等信息见“Microarray_sample_info.txt”。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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