IDR idr0161-yayon-thymus 胸腺细胞组织成像数据集(experimentA)

主题标签:免疫系统疾病、胸腺、细胞组织成像、IDR、OME/EMBL-EBI。本站分类:免疫系统疾病/其他。本数据集为免疫系统疾病领域公开数据集,主题涵盖免疫系统疾病。

idr
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图像图像分割免疫系统疾病胸腺细胞组织成像IDROME/EMBL-EBI
IDR idr0161-yayon-thymus (experimentA)

基本信息

模态
图像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

IDR idr0161-yayon-thymus 胸腺细胞组织成像数据集(experimentA)

IDR idr0161-yayon-thymus(experimentA)是一个来自 Image Data Resource(IDR)的公开细胞与组织成像数据集,主题聚焦于免疫系统疾病与胸腺相关研究。该数据集由 OME/EMBL-EBI 维护的 IDR 平台收录,属于经过策展的成像研究资源,本站将其归类于“免疫系统疾病 / 其他”。数据集包含 3 幅图像,来源于 IDR 研究 idr0161-yayon-thymus 的 experimentA 实验部分。作为免疫系统疾病领域的公开数据集,其主题标签涵盖免疫系统疾病、胸腺、细胞组织成像、IDR 以及 OME/EMBL-EBI,适合关注胸腺组织形态与免疫相关成像的研究者检索与使用。

【数据集背景】

该数据集属于 Image Data Resource(IDR)平台收录的策展型细胞与组织成像研究。IDR 由 OME/EMBL-EBI 维护,致力于汇集、整理并公开可复用的生物成像数据。idr0161-yayon-thymus 这一研究以胸腺为对象,本站分类将其归入免疫系统疾病方向下的“其他”类别,说明其主题与免疫系统疾病相关,但未进一步细分至具体疾病亚类。数据集对应研究中的 experimentA 实验部分,是该研究公开成像数据的一个组成单元。

【数据内容】

数据集包含 3 幅图像,内容主题为胸腺相关的细胞与组织成像。图像以 OME 数据模型组织,属于 IDR 策展研究中的成像数据。除图像数量与主题标签外,源站未提供关于图像尺寸、通道数、分辨率、染色标记、样本类型或实验分组的进一步说明。该数据集不包含除 experimentA 之外其他实验部分的描述信息。

【采集与来源】

数据来源于 idr.openmicroscopy.org,即 Image Data Resource 的公开访问站点。源站将其描述为 IDR 研究 idr0161-yayon-thymus 的 experimentA 实验,图像数量为 3。该研究由 IDR 进行策展,依托 OME/EMBL-EBI 的成像数据基础设施发布。关于具体的成像仪器、采集参数、样本制备流程与实验地点,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签,该数据集可用于免疫系统疾病与胸腺相关的细胞组织成像观察,也可作为 IDR 策展成像数据的检索与浏览对象。由于数据规模较小(3 幅图像),其更适合作为特定研究实验的示例性成像资料,用于了解该研究在 IDR 中的公开数据形态,或与其他 IDR 免疫相关数据集配合进行资源层面的检索与整合。源站未提供该数据集在具体分析任务中的验证性用途说明。

【使用方法】

该数据集可通过 IDR 公开站点 idr.openmicroscopy.org 访问,按研究标识 idr0161-yayon-thymus 及实验标识 experimentA 定位。图像遵循 OME 数据模型,可借助 IDR 提供的浏览与检索界面查看。关于下载方式、API 调用、图像格式转换或与其他工具的对接细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 IDR 策展研究的一部分,具备平台层面的策展与组织保障。其明显限制在于图像数量仅为 3 幅,规模有限;同时,源站未提供图像分辨率、通道、标注、重复样本或质控指标等信息,难以据此评估成像质量与生物学代表性。本站分类为“免疫系统疾病 / 其他”,表明其疾病细分信息有限。使用时应以源站页面所载信息为准。

【引用与许可】

该数据集来自 IDR(idr.openmicroscopy.org),由 OME/EMBL-EBI 维护。关于该研究的具体引用文献、作者列表、数据许可条款与使用限制,源站未提供,使用前应查阅 IDR 研究页面获取相应说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-3051

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0161-yayon-thymus. Experiment: experimentA. Images: 3. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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