HIV共受体使用决定T淋巴细胞中特异性miRNA调控

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-3139

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

HIV-1和HIV-2是获得性免疫缺陷综合征（AIDS）的两种病原体。这两种逆转录病毒在地理分布、复制、传播以及进展为AIDS方面存在若干差异。解释这些特征的分子机制在很大程度上尚不清楚。一个可能的原因在于宿主因素能够以不同方式对抗HIV复制。在这些因素中，细胞微小RNA（miRNA）近年来被认为发挥着关键作用。HIV与宿主miRNA之间复杂相互作用的一个方面是HIV-1能够调节宿主miRNA，从而为其复制创造有利条件。在此，我们试图采用基于miRNA芯片的无偏实验策略，比较HIV-1和HIV-2所引发的miRNA调节。令人惊讶的是，我们观察到当利用CD4和CXCR4进入细胞时，这两种不相关的HIV以相似方式调节宿主miRNA库。然而，这些调节与HIV-1利用CD4和CCR5所触发的改变不同。根据miRNA的作用方式，我们的观察在mRNA水平上得到了证实。

我们得出结论，决定宿主miRNA谱系调节的关键事件是辅助受体利用（CXCR4或CCR5），而非基因组组织与系统发育。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。