JunB转录因子在Th17细胞分化中的必需性研究数据集
该数据集来自NCBI GEO,包含一项关于AP-1转录因子JunB在Th17细胞分化中必需作用的研究。数据通过高通量测序对小鼠CD4+ T细胞进行RNA-seq转录组分析,覆盖Th17细胞特异性基因表达程序及JunB与BATF形成异二聚体激活Th17特征基因的机制

基本信息
资源简介
JunB转录因子在Th17细胞分化中的必需性研究数据集
The AP-1 Transcription Factor JunB Is Required for Th17 Cell Differentiation
该数据集来自NCBI GEO,包含一项关于AP-1转录因子JunB在Th17细胞分化中必需作用的研究。数据通过高通量测序对小鼠CD4+ T细胞进行RNA-seq转录组分析,覆盖Th17细胞特异性基因表达程序及JunB与BATF形成异二聚体激活Th17特征基因的机制。数据可用于研究Th17细胞分化调控、自身免疫性疾病发病机制及JunB相关基因表达分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 26 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):产生白细胞介素(IL)-17的辅助性T(Th17)细胞对于宿主防御胞外微生物和自身免疫性疾病的发病机制至关重要。在此我们表明,AP-1转录因子JunB是Th17细胞发育所必需的。Junb缺陷的CD4+ T细胞在体外能够发育为除Th17外的各种辅助性T细胞亚群。RNA-seq转录组分析揭示,JunB对Th17特异性基因表达程序至关重要。Junb缺陷小鼠对实验性自身免疫性脑脊髓炎(一种Th17介导的炎症性疾病)完全抵抗,且来自此类小鼠的初始辅助性T细胞无法分化为Th17细胞。JunB似乎通过与BATF(另一种对Th17分化至关重要的AP-1因子)形成异二聚体来激活Th17特征基因。JunB控制Th17细胞发育的机制可能涉及激活这些基因
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL17021、10090。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE98242
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 25 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
产生白细胞介素(IL)-17的辅助性T细胞(Th17)对于宿主防御胞外微生物及自身免疫性疾病发病机制至关重要。本研究表明,AP-1转录因子JunB是Th17细胞发育所必需的。Junb缺陷的CD4+ T细胞在体外能够发育为各种辅助性T细胞亚群,但除外Th17。RNA-seq转录组分析揭示,JunB对Th17特异性基因表达程序至关重要。Junb缺陷小鼠对实验性自身免疫性脑脊髓炎(一种Th17介导的炎症性疾病)完全抵抗,且此类小鼠的初始辅助性T细胞无法分化为Th17细胞。JunB似乎通过与BATF(另一种对Th17分化至关重要的AP-1因子)形成异二聚体来激活Th17特征性基因。JunB调控Th17细胞发育的机制可能涉及激活Th17谱系特异性孤儿受体RORγt和RORα的基因,以及降低Foxp3(一种已知拮抗RORγt功能的转录因子)的表达。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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