MOG免疫后7天腹股沟淋巴结CD4+ T细胞表达数据
该数据集来自NCBI GEO,标题为MOG免疫后7天腹股沟淋巴结分离的CD4+ T细胞表达数据,采用芯片表达谱平台GPL6247,物种编号10116

基本信息
资源简介
MOG免疫后7天腹股沟淋巴结CD4+ T细胞表达数据
GSE92680 数据集来自 NCBI GEO,全称为“Expression data from CD4+ T cells isolated from inguinal lymph nodes 7 days post MOG immunization”,即 MOG 免疫后 7 天从腹股沟淋巴结分离的 CD4+ T 细胞表达数据。该数据集属于免疫系统疾病 / 其他分类,采用芯片表达谱技术(Expression profiling by array),平台为 GPL6247,物种编号 10116。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE92680_series_matrix.txt.gz,作者为 M,Zeitelhofer,发布时间为 Dec 21 201。整体而言,该数据集记录了特定免疫刺激条件下引流淋巴结中 CD4+ T 细胞的基因表达谱,可用于免疫系统疾病相关研究中的表达模式分析。
【数据集背景】
该数据集关注 MOG 免疫后 7 天腹股沟淋巴结中 CD4+ T 细胞的基因表达情况。源站描述提到,研究者从 EAE 模型引流淋巴结中分离 CD4+ T 细胞,时间点为免疫后 7 天。EAE 是实验性自身免疫性脑脊髓炎的常用缩写,MOG 免疫是诱导该模型的常见方式。该数据集属于免疫系统疾病 / 其他分类,主题标签包括 Expression profiling by array、GPL6247 和 10116,分别对应芯片表达谱、平台编号和物种编号。数据集标题明确限定了细胞类型(CD4+ T 细胞)、组织来源(腹股沟淋巴结)和时间点(MOG 免疫后 7 天),为研究者理解其生物学背景提供了基本框架。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE92680_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,属于芯片表达谱系列矩阵文件,通常用于承载样本层面的表达数据。主题标签中的 Expression profiling by array 表明数据由芯片表达谱技术产生,GPL6247 为对应平台编号,10116 为物种编号。源站未提供样本数量、分组设计、探针数量、表达值范围等更细粒度的数据内容信息。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。源站标题与数据集英文名一致,均为“Expression data from CD4+ T cells isolated from inguinal lymph nodes 7 days post MOG immunization”。源站描述指出,研究者从 EAE 引流淋巴结中分离 CD4+ T 细胞,时间点为免疫后 7 天。作者为 M,Zeitelhofer,发布时间为 Dec 21 201。数据集分类为免疫系统疾病 / 其他。除上述信息外,源站未提供具体的实验操作流程、样本处理细节、芯片杂交条件或数据预处理步骤。
【适用场景】
该数据集适用于免疫系统疾病相关研究,尤其是围绕 MOG 免疫后引流淋巴结 CD4+ T 细胞表达谱的分析。由于采用芯片表达谱平台 GPL6247,可用于比较不同样本间的基因表达模式、筛选差异表达基因或开展通路层面的探索性分析。主题标签中的物种编号 10116 提示其适用于该物种的转录组研究。数据集也可作为免疫学研究中 CD4+ T 细胞活化、分化或迁移相关假设生成的参考数据。源站未提供具体的适用分析类型或已验证的分析结论。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE92680_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,读取前需按 GZIP 格式解压或直接以支持 GZIP 的工具打开。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件,使用时应以该系列矩阵文件为核心数据载体。源站未提供配套的注释文件、分析脚本或标准化流程说明。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件,数据规模有限。源站未提供样本数量、重复设置、数据质量控制指标、缺失值情况或批次信息,因此无法据此评估数据质量。源站描述仅提及从 EAE 引流淋巴结分离 CD4+ T 细胞,未提供更完整的实验设计与统计效力说明。使用时应注意数据集分类为免疫系统疾病 / 其他,主题标签仅覆盖芯片表达谱、平台和物种编号,未提供更细的疾病亚型或干预条件信息。源站未提供数据更新记录或版本说明。
【引用与许可】
作者为 M,Zeitelhofer,发布时间为 Dec 21 201。数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov)。源站未提供具体的引用格式、期刊论文信息、许可条款或使用限制说明。使用该数据集时应遵循 NCBI GEO 的通用数据使用规范,并建议在相关研究中注明数据集编号 GSE92680 及来源数据库。源站未提供额外的许可或授权细节。
下载信息
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无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE92680
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
We isolated CD4+ T cells from draining lymph nodes 7 days post EAE from DA rats treated with vitamin D supplemented, vitamin D deprived or regular diet
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