人类卵泡细胞转录组特征与体外受精失败关联数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE87545

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IVF成功率仍然较低（通常约为30%），且需要多个周期才能实现妊娠，这给患者和社会带来了问题。IVF的成功或失败主要取决于所获卵母细胞的质量以及患者对卵巢刺激的反应。IVF前的激素刺激会影响卵巢环境，进而影响卵母细胞及后续胚胎质量。我们认为，如果临床医生能够获得更多信息来分析周期失败的原因，他们就可以相应地调整下一次刺激方案并提高成功率。我们认为特定的分子特征与失败原因相关，RNA分析可作为诊断工具。本研究的目的是比较失败与成功IVF周期之间的基因表达，并确定失败周期卵泡中基因表达受到何种影响。使用微阵列分析了从IVF患者（n=32）获得的卵泡细胞中的基因表达。将IVF周期后未妊娠的患者与妊娠患者进行了比较。

采用定量RT-PCR验证微阵列结果，并运用Ingenuity通路分析进行功能分析。两组之间有165个基因差异表达，包括许多促炎细胞因子或其他与炎症相关的因子。例如，与阳性组相比，阴性组中EGR1、IL1B、IL8、CXCL2、CCL3和CCL4均上调。若干因子的过表达（其中一些作用于VEGF上游）提示通透性增加和血管舒张。阴性组中免疫细胞向卵巢组织的募集似乎也更为明显，可能反映白细胞增多。我们的结果表明，在IVF失败组中，促炎与抗炎介质之间的平衡受损，并提示存在一种影响卵母细胞但不导致全身性问题的中间型OHSS状态。一些差异表达

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。