HIV相关结核性脑膜炎血液转录特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE83892

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

已知HIV相关结核性脑膜炎（TBM）患者在开始抗逆转录病毒治疗（ART）后会出现全身性过度炎症，临床上称为免疫重建炎症综合征（IRIS）。迄今为止，尚未发现预后标志物或生物标志物，且对介导这种过度炎症的机制知之甚少。我们招募了一个由33例HIV相关TBM患者组成的前瞻性队列，其中16例发生了TBM-IRIS，并进行了转录组分析。研究识别出了能够区分最终会发生IRIS患者的转录组特征，并表明中性粒细胞和炎症小体激活是TBM-IRIS发病机制的主要介导因素。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。