Tristetraprolin对中性粒细胞转录组转录后调控促进凋亡并削弱宿主抗菌防御

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE77801

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

中性粒细胞中mRNA水平的转录后调控及其对免疫应答的影响尚未被探索。通过中性粒细胞转录组分析，我们发现mRNA去稳定蛋白tristetraprolin（TTP）限制数百个基因的表达，包括负调控凋亡的基因。诱发的TTP缺陷中性粒细胞表现出凋亡减少和数量增加。抗凋亡蛋白Mcl-1在TTP缺陷中性粒细胞中升高，且Mcl1 mRNA被TTP结合并去稳定化。在巨噬细胞和中性粒细胞中敲除TTP可改善小鼠在侵袭性化脓性链球菌感染期间的防御和生存。缺乏髓系TTP的小鼠通过大量但受控的中性粒细胞部署，阻止了细菌播散并有效减弱了全身性疾病。这些数据表明TTP的转录后控制可限制中性粒细胞和抗菌防御。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。