耐受性树突状细胞免疫相关基因鉴定数据集
该数据集来自 NCBI GEO,标题为耐受性树突状细胞中免疫相关基因的鉴定,比较 ITP 患者中诱导调节性 T 细胞处理与未处理树突状细胞的基因表达数据

基本信息
资源简介
耐受性树突状细胞免疫相关基因鉴定数据集
GSE7387 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,英文标题为 Identification of immune-related genes in tolerogenic dendritic cells,中文可译为“耐受性树突状细胞中免疫相关基因的鉴定”。该数据集聚焦免疫系统疾病相关研究,通过表达谱芯片比较免疫性血小板减少症(ITP)患者中经诱导调节性 T 细胞处理的树突状细胞与未经处理树突状细胞的基因表达差异,旨在识别与耐受性树突状细胞相关的免疫相关基因。数据集由 Xiao-lin,Zhang 提交,包含 1 个可供下载的数据文件,适合用于免疫调控机制与树突状细胞功能研究中的表达谱分析。
【数据集背景】
该数据集围绕耐受性树突状细胞(tolerogenic dendritic cells)的免疫相关基因鉴定展开。树突状细胞是免疫系统中重要的抗原呈递细胞,其耐受性状态与免疫耐受的建立和维持密切相关。源站描述指出,该研究比较了来自 ITP 患者的诱导调节性 T 细胞处理组与未处理组的树突状细胞的基因表达数据,用以寻找与耐受性树突状细胞功能相关的免疫基因。数据集所属分类为免疫系统疾病 / 其他,主题标签包含 Expression profiling by array、GPL5045 与 9606,分别对应芯片表达谱平台、平台编号和人类物种信息。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE7387_series_matrix.txt.gz,即 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。该文件通常承载样本层面的表达谱矩阵信息,可用于比较处理组与未处理组树突状细胞之间的基因表达差异。数据集主题标签表明其数据类型为芯片表达谱(Expression profiling by array),平台标识为 GPL5045,物种标识为 9606(人类)。源站标题与描述共同说明,数据内容的核心是比较 ITP 患者来源的树突状细胞在诱导调节性 T 细胞处理前后的表达谱变化。
【采集与来源】
数据集来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),由 Xiao-lin,Zhang 提交,发布时间为 Mar 28 200。源站描述明确说明数据来自对 ITP 患者诱导调节性 T 细胞处理与未处理树突状细胞的基因表达比较。除上述信息外,样本采集地点、伦理审批、患者纳入标准等细节源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于免疫系统疾病特别是 ITP 相关免疫机制研究,可用于探索耐受性树突状细胞中免疫相关基因的表达变化,比较诱导调节性 T 细胞处理对树突状细胞表达谱的影响,也可作为芯片表达谱分析、差异表达基因筛选和免疫调控通路研究的参考数据。由于主题标签涉及人类物种与芯片平台,适合在人类基因表达谱背景下开展方法学验证与生物信息学分析。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE7387_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。分析时可结合平台标识 GPL5045 与物种标识 9606 对探针与基因注释进行对应,并围绕处理组与未处理组的比较设计差异表达分析。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,源站未提供样本量、重复数、质控指标与批次信息等质量细节。由于源站描述较为简短,关于数据预处理方法、归一化策略及统计阈值等信息源站未提供。使用时应注意数据集规模有限,结论外推需谨慎。
【引用与许可】
数据集作者为 Xiao-lin,Zhang,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。引用方式与许可条款源站未提供,使用前应查阅源站页面获取正式引用与使用规定。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE7387
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
比较来自ITP患者的诱导调节性T细胞处理与未处理树突状细胞的基因表达数据。关键词:调节性T细胞,树突状细胞
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