迁移原代人表皮角质形成细胞中组蛋白修饰H3K27ac、H3K4me3和H3K4me1的全基因组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE68075

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

表皮是一种复层鳞状上皮，起到保护机体免受脱水、化学物质吸收以及病原体侵袭的作用。它来源于哺乳动物胚胎发育后期的表面外胚层。在复层鳞状上皮中，基底层的细胞具有增殖潜能。随着细胞分裂并向组织上方移动，它们逐渐分化，并激活构建屏障所需的基因表达程序；最终，最上层的细胞从表皮表面脱落。这一系统需要基底层不断补充分化中的细胞。该过程需要非常精确的基因表达调控，以平衡增殖与分化并维持上皮的功能。已知多种转录因子对维持这种平衡至关重要，其中包括p63、Notch、c-myc、Klf4和Grhl3。这些因子在一个复杂的表皮分化网络中相互作用，各因子的贡献为分化过程提供了平衡与精确性。

当伤口导致表皮屏障破损时，一系列细胞因子和其他信号分子会激活一个伤口愈合的基因表达程序，诱导从血液凝固、免疫细胞浸润皮肤、血管和淋巴管再生，到角质形成细胞协调迁移至伤口中心并随后发生分层的一切过程，而所有这些对于再生丢失的组织都是必需的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。