Tristetraprolin (TTP) 调控的“Triple KO”小鼠脾脏转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE60243

标准获取流程：

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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Tristetraprolin（TTP）与特定转录本3’UTR中的AU富集元件结合，通过增加mRNA降解速率来调控转录后基因表达。本研究评估了TTP缺陷对脾组织整体基因表达的影响，以期发现正常生理条件下TTP的组织特异性靶标。我们使用了TTP及两种TNF受体均缺陷的“三敲除”（Zfp36-/-/TNFR1-/-/TNFR2-/-）小鼠，并将其转录组变化与“双敲除”（TNFR1-/-/TNFR2-/-）小鼠及野生型小鼠进行比较。来自四只野生型、四只“双敲除”和四只“三敲除”小鼠的脾mRNA分两个阶段进行了RNA-Seq。本研究使用的所有动物均为12-14周龄雄性，背景为混合背景（75% C57BL/6NTac，25% 129/SVEV）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。