巨噬细胞活化中特定mRNA的翻译调控与反馈抑制及存活[芯片]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE52449

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

当巨噬细胞遇到病原体时，它们会短暂诱导一系列协调有序的促炎和抗炎基因级联表达。我们系统分析了翻译调控在巨噬细胞活化早期阶段的贡献。虽然大多数细胞因子的表达受mRNA水平变化的调控，但研究发现翻译的去抑制使得许多炎症反应的反馈抑制因子得以表达。这包括NF-κB抑制剂（IκBδ、IκBζ、Nr4a1、Ier3）、p38 MAPK拮抗剂（Dusp1）以及细胞因子表达的转录后抑制因子（TTP和Zc3h12a）。Ier3在mRNA丰度和翻译水平上与TNF紧密协同调控。缺乏Ier3的巨噬细胞在活化后存活率降低，表明Ier3的诱导是保护巨噬细胞免受脂多糖诱导的细胞死亡所必需的。我们的分析揭示了翻译调控在炎症消退和巨噬细胞存活中的重要作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。