脑膜炎奈瑟菌在人血-脑脊液屏障模型中诱导涉及IκBζ的促炎反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE42870

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数据说明

人类特异性革兰氏阴性细菌脑膜炎奈瑟菌(Nm)是全球细菌性脑膜炎的主要病因。已有描述表明，Nm可通过血-脑脊液屏障(BCSFB)进入中枢神经系统，该屏障由脉络丛上皮细胞构成。利用近期建立的基于人恶性脉络丛乳头状瘤(HIBCPP)细胞的人BCSFB体外模型，我们研究了HIBCPP细胞对致脑膜炎Nm菌株MC58攻击的细胞反应。作为对比，我们分析了对密切相关的无荚膜携带者分离株Nm α14的应答。转录组分析显示，感染MC58菌株后转录反应更强，尤其是其荚膜缺陷突变体MC58siaD-，这与细菌侵袭水平相关。表达评估和基因集富集分析指向一种NF-κB介导的促炎免疫反应，涉及转录因子IκBζ的上调。

与此一致，受感染的细胞分泌了显著水平的促炎趋化因子和细胞因子，其中包括IL8、CXCL1-3以及IκBζ靶基因产物IL6。HIBCPP细胞中模式识别受体的表达谱及对特定激动剂的反应表明，在Nm感染后的细胞反应中，涉及的是TLR2而非TLR4。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。