实验感染Brucella ovis粗糙强毒株公羊基因表达芯片分析（慢性1期）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE35613

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数据说明

该研究通过微阵列分析，展示了实验感染布鲁氏菌绵羊种粗糙（R）强毒株的公羊在生殖器官（附睾、睾丸、壶腹、精囊腺、尿道球腺）及淋巴结池（腹股沟和阴囊）中总mRNA的基因表达情况，分别在感染后的三个不同时间点进行：急性期（攻毒后60天[dpc]）、慢性期1（120dpc）和慢性期2（240dpc）。为进一步明确与感染公羊相关的基因表达变化，使用Affymetrix牛基因组阵列比较了对照组（0 dpc）公羊的表达谱。在阵列分析的23,000个基因中，感染布鲁氏菌的公羊组织在急性期、慢性期1和慢性期2分别显示出139、930和744个差异表达基因（DEGs）。在这三个感染阶段中，共有44个DEGs（30个已知基因和14个未知基因）共同表达。在感染的三个时期，免疫细胞运输、免疫疾病、传染病、炎症性疾病、炎症反应和细胞运动的生物学功能均显著。

结果支持了对感染B. ovis R株的公羊组织进行的首次微阵列分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。